Protein–RNA interactions for Protein: Q02788

Col6a2, Collagen alpha-2(VI) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,034 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col6a2Q02788 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Col6a2Q02788 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Col6a2Q02788 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Col6a2Q02788 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Col6a2Q02788 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Col6a2Q02788 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Col6a2Q02788 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Col6a2Q02788 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Col6a2Q02788 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Col6a2Q02788 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Col6a2Q02788 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Col6a2Q02788 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Col6a2Q02788 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Col6a2Q02788 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Col6a2Q02788 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Col6a2Q02788 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Col6a2Q02788 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Col6a2Q02788 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Col6a2Q02788 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Col6a2Q02788 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Col6a2Q02788 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Col6a2Q02788 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Col6a2Q02788 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Col6a2Q02788 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Col6a2Q02788 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Col6a2Q02788 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Col6a2Q02788 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Col6a2Q02788 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Col6a2Q02788 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Col6a2Q02788 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Col6a2Q02788 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Col6a2Q02788 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Col6a2Q02788 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Col6a2Q02788 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Col6a2Q02788 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Col6a2Q02788 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Col6a2Q02788 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Col6a2Q02788 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Col6a2Q02788 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Col6a2Q02788 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Col6a2Q02788 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Col6a2Q02788 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Col6a2Q02788 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Col6a2Q02788 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Col6a2Q02788 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Col6a2Q02788 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Col6a2Q02788 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Col6a2Q02788 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Col6a2Q02788 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Col6a2Q02788 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Col6a2Q02788 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Col6a2Q02788 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Col6a2Q02788 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Col6a2Q02788 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Col6a2Q02788 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Col6a2Q02788 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Col6a2Q02788 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Col6a2Q02788 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Col6a2Q02788 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Col6a2Q02788 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Col6a2Q02788 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Col6a2Q02788 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Col6a2Q02788 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Col6a2Q02788 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Col6a2Q02788 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Col6a2Q02788 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Col6a2Q02788 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Col6a2Q02788 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Col6a2Q02788 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Col6a2Q02788 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Col6a2Q02788 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Col6a2Q02788 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Col6a2Q02788 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Col6a2Q02788 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Col6a2Q02788 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Col6a2Q02788 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Col6a2Q02788 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Col6a2Q02788 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Col6a2Q02788 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Col6a2Q02788 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Col6a2Q02788 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Col6a2Q02788 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Col6a2Q02788 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Col6a2Q02788 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Col6a2Q02788 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Col6a2Q02788 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Col6a2Q02788 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Col6a2Q02788 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Col6a2Q02788 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Col6a2Q02788 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Col6a2Q02788 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Col6a2Q02788 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Col6a2Q02788 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Col6a2Q02788 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Col6a2Q02788 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Col6a2Q02788 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Col6a2Q02788 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Col6a2Q02788 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Col6a2Q02788 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Col6a2Q02788 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms