Protein–RNA interactions for Protein: Q02739

Gjb5, Gap junction beta-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb5Q02739 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gjb5Q02739 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gjb5Q02739 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gjb5Q02739 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gjb5Q02739 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Gjb5Q02739 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gjb5Q02739 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Gjb5Q02739 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gjb5Q02739 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Gjb5Q02739 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gjb5Q02739 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gjb5Q02739 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gjb5Q02739 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gjb5Q02739 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gjb5Q02739 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gjb5Q02739 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gjb5Q02739 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gjb5Q02739 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gjb5Q02739 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gjb5Q02739 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gjb5Q02739 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gjb5Q02739 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gjb5Q02739 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gjb5Q02739 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gjb5Q02739 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gjb5Q02739 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gjb5Q02739 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Gjb5Q02739 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Gjb5Q02739 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gjb5Q02739 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gjb5Q02739 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Gjb5Q02739 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gjb5Q02739 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gjb5Q02739 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gjb5Q02739 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gjb5Q02739 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gjb5Q02739 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gjb5Q02739 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gjb5Q02739 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gjb5Q02739 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gjb5Q02739 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gjb5Q02739 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gjb5Q02739 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gjb5Q02739 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gjb5Q02739 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gjb5Q02739 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gjb5Q02739 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gjb5Q02739 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gjb5Q02739 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gjb5Q02739 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gjb5Q02739 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gjb5Q02739 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gjb5Q02739 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gjb5Q02739 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gjb5Q02739 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gjb5Q02739 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gjb5Q02739 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gjb5Q02739 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gjb5Q02739 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gjb5Q02739 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gjb5Q02739 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Gjb5Q02739 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gjb5Q02739 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gjb5Q02739 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gjb5Q02739 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gjb5Q02739 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Gjb5Q02739 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Gjb5Q02739 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gjb5Q02739 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gjb5Q02739 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gjb5Q02739 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gjb5Q02739 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Gjb5Q02739 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gjb5Q02739 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gjb5Q02739 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gjb5Q02739 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gjb5Q02739 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gjb5Q02739 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gjb5Q02739 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gjb5Q02739 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gjb5Q02739 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gjb5Q02739 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Gjb5Q02739 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gjb5Q02739 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gjb5Q02739 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gjb5Q02739 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gjb5Q02739 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gjb5Q02739 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gjb5Q02739 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gjb5Q02739 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gjb5Q02739 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gjb5Q02739 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gjb5Q02739 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Gjb5Q02739 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gjb5Q02739 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gjb5Q02739 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gjb5Q02739 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Gjb5Q02739 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gjb5Q02739 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gjb5Q02739 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.2 ms