Protein–RNA interactions for Protein: Q02242

Pdcd1, Programmed cell death protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd1Q02242 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Pdcd1Q02242 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pdcd1Q02242 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Pdcd1Q02242 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pdcd1Q02242 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Pdcd1Q02242 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pdcd1Q02242 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pdcd1Q02242 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pdcd1Q02242 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pdcd1Q02242 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pdcd1Q02242 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pdcd1Q02242 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pdcd1Q02242 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pdcd1Q02242 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pdcd1Q02242 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pdcd1Q02242 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pdcd1Q02242 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pdcd1Q02242 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Pdcd1Q02242 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pdcd1Q02242 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pdcd1Q02242 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Pdcd1Q02242 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pdcd1Q02242 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Pdcd1Q02242 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Pdcd1Q02242 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pdcd1Q02242 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pdcd1Q02242 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pdcd1Q02242 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pdcd1Q02242 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pdcd1Q02242 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pdcd1Q02242 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pdcd1Q02242 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pdcd1Q02242 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pdcd1Q02242 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pdcd1Q02242 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pdcd1Q02242 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pdcd1Q02242 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Pdcd1Q02242 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pdcd1Q02242 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pdcd1Q02242 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pdcd1Q02242 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pdcd1Q02242 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pdcd1Q02242 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pdcd1Q02242 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Pdcd1Q02242 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Pdcd1Q02242 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Pdcd1Q02242 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Pdcd1Q02242 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Pdcd1Q02242 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Pdcd1Q02242 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pdcd1Q02242 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pdcd1Q02242 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pdcd1Q02242 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pdcd1Q02242 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pdcd1Q02242 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pdcd1Q02242 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pdcd1Q02242 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pdcd1Q02242 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pdcd1Q02242 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pdcd1Q02242 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pdcd1Q02242 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pdcd1Q02242 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pdcd1Q02242 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pdcd1Q02242 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pdcd1Q02242 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pdcd1Q02242 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pdcd1Q02242 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pdcd1Q02242 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pdcd1Q02242 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pdcd1Q02242 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pdcd1Q02242 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pdcd1Q02242 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pdcd1Q02242 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pdcd1Q02242 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pdcd1Q02242 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Pdcd1Q02242 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pdcd1Q02242 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pdcd1Q02242 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pdcd1Q02242 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pdcd1Q02242 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pdcd1Q02242 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pdcd1Q02242 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pdcd1Q02242 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pdcd1Q02242 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pdcd1Q02242 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pdcd1Q02242 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pdcd1Q02242 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pdcd1Q02242 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pdcd1Q02242 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pdcd1Q02242 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pdcd1Q02242 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pdcd1Q02242 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pdcd1Q02242 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pdcd1Q02242 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pdcd1Q02242 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Pdcd1Q02242 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Pdcd1Q02242 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pdcd1Q02242 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pdcd1Q02242 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pdcd1Q02242 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms