Protein–RNA interactions for Protein: Q01887

Ryk, Tyrosine-protein kinase RYK, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RykQ01887 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RykQ01887 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RykQ01887 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RykQ01887 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RykQ01887 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RykQ01887 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RykQ01887 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RykQ01887 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RykQ01887 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RykQ01887 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RykQ01887 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RykQ01887 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RykQ01887 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RykQ01887 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RykQ01887 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RykQ01887 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RykQ01887 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RykQ01887 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RykQ01887 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RykQ01887 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RykQ01887 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RykQ01887 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RykQ01887 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RykQ01887 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RykQ01887 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RykQ01887 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RykQ01887 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RykQ01887 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RykQ01887 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RykQ01887 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RykQ01887 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RykQ01887 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RykQ01887 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RykQ01887 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RykQ01887 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RykQ01887 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RykQ01887 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RykQ01887 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RykQ01887 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RykQ01887 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RykQ01887 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RykQ01887 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RykQ01887 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RykQ01887 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RykQ01887 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RykQ01887 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RykQ01887 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RykQ01887 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RykQ01887 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RykQ01887 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RykQ01887 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RykQ01887 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RykQ01887 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RykQ01887 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RykQ01887 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RykQ01887 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RykQ01887 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RykQ01887 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RykQ01887 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RykQ01887 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RykQ01887 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RykQ01887 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RykQ01887 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RykQ01887 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RykQ01887 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RykQ01887 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RykQ01887 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RykQ01887 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RykQ01887 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RykQ01887 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RykQ01887 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RykQ01887 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RykQ01887 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RykQ01887 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RykQ01887 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RykQ01887 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RykQ01887 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RykQ01887 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RykQ01887 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RykQ01887 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RykQ01887 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RykQ01887 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RykQ01887 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RykQ01887 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RykQ01887 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RykQ01887 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RykQ01887 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RykQ01887 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RykQ01887 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RykQ01887 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RykQ01887 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RykQ01887 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RykQ01887 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RykQ01887 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RykQ01887 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RykQ01887 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RykQ01887 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RykQ01887 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RykQ01887 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RykQ01887 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms