Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxd1Q01822 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxd1Q01822 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxd1Q01822 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxd1Q01822 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxd1Q01822 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxd1Q01822 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxd1Q01822 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxd1Q01822 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxd1Q01822 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxd1Q01822 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxd1Q01822 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxd1Q01822 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxd1Q01822 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxd1Q01822 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxd1Q01822 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxd1Q01822 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxd1Q01822 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxd1Q01822 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxd1Q01822 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxd1Q01822 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxd1Q01822 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxd1Q01822 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxd1Q01822 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxd1Q01822 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxd1Q01822 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxd1Q01822 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxd1Q01822 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxd1Q01822 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxd1Q01822 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxd1Q01822 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxd1Q01822 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxd1Q01822 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxd1Q01822 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxd1Q01822 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxd1Q01822 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxd1Q01822 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxd1Q01822 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxd1Q01822 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxd1Q01822 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxd1Q01822 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxd1Q01822 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxd1Q01822 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxd1Q01822 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxd1Q01822 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxd1Q01822 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxd1Q01822 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxd1Q01822 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxd1Q01822 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxd1Q01822 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxd1Q01822 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxd1Q01822 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxd1Q01822 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxd1Q01822 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxd1Q01822 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxd1Q01822 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxd1Q01822 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxd1Q01822 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxd1Q01822 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxd1Q01822 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxd1Q01822 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxd1Q01822 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxd1Q01822 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxd1Q01822 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxd1Q01822 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxd1Q01822 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxd1Q01822 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxd1Q01822 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxd1Q01822 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxd1Q01822 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxd1Q01822 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxd1Q01822 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxd1Q01822 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxd1Q01822 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxd1Q01822 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxd1Q01822 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxd1Q01822 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxd1Q01822 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxd1Q01822 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxd1Q01822 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxd1Q01822 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxd1Q01822 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxd1Q01822 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxd1Q01822 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxd1Q01822 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxd1Q01822 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxd1Q01822 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxd1Q01822 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxd1Q01822 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxd1Q01822 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxd1Q01822 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxd1Q01822 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxd1Q01822 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxd1Q01822 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxd1Q01822 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxd1Q01822 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxd1Q01822 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxd1Q01822 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxd1Q01822 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxd1Q01822 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms