Protein–RNA interactions for Protein: Q01279

Egfr, Epidermal growth factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EgfrQ01279 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
EgfrQ01279 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
EgfrQ01279 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
EgfrQ01279 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
EgfrQ01279 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
EgfrQ01279 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
EgfrQ01279 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
EgfrQ01279 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
EgfrQ01279 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
EgfrQ01279 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
EgfrQ01279 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
EgfrQ01279 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
EgfrQ01279 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
EgfrQ01279 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
EgfrQ01279 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
EgfrQ01279 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
EgfrQ01279 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
EgfrQ01279 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
EgfrQ01279 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
EgfrQ01279 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
EgfrQ01279 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
EgfrQ01279 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
EgfrQ01279 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
EgfrQ01279 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
EgfrQ01279 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
EgfrQ01279 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
EgfrQ01279 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
EgfrQ01279 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
EgfrQ01279 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
EgfrQ01279 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
EgfrQ01279 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
EgfrQ01279 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
EgfrQ01279 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
EgfrQ01279 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
EgfrQ01279 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
EgfrQ01279 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
EgfrQ01279 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
EgfrQ01279 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
EgfrQ01279 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
EgfrQ01279 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
EgfrQ01279 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
EgfrQ01279 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
EgfrQ01279 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
EgfrQ01279 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
EgfrQ01279 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
EgfrQ01279 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
EgfrQ01279 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
EgfrQ01279 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
EgfrQ01279 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
EgfrQ01279 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
EgfrQ01279 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
EgfrQ01279 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
EgfrQ01279 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
EgfrQ01279 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
EgfrQ01279 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
EgfrQ01279 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
EgfrQ01279 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
EgfrQ01279 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
EgfrQ01279 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
EgfrQ01279 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
EgfrQ01279 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
EgfrQ01279 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
EgfrQ01279 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
EgfrQ01279 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
EgfrQ01279 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
EgfrQ01279 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
EgfrQ01279 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
EgfrQ01279 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
EgfrQ01279 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
EgfrQ01279 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
EgfrQ01279 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
EgfrQ01279 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
EgfrQ01279 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
EgfrQ01279 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
EgfrQ01279 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
EgfrQ01279 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
EgfrQ01279 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
EgfrQ01279 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
EgfrQ01279 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
EgfrQ01279 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
EgfrQ01279 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
EgfrQ01279 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
EgfrQ01279 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
EgfrQ01279 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
EgfrQ01279 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
EgfrQ01279 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
EgfrQ01279 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
EgfrQ01279 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
EgfrQ01279 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
EgfrQ01279 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
EgfrQ01279 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
EgfrQ01279 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
EgfrQ01279 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
EgfrQ01279 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
EgfrQ01279 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
EgfrQ01279 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
EgfrQ01279 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
EgfrQ01279 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
EgfrQ01279 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
EgfrQ01279 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms