Protein–RNA interactions for Protein: Q01149

Col1a2, Collagen alpha-2(I) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col1a2Q01149 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Col1a2Q01149 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Col1a2Q01149 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Col1a2Q01149 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Col1a2Q01149 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Col1a2Q01149 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Col1a2Q01149 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Col1a2Q01149 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Col1a2Q01149 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Col1a2Q01149 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Col1a2Q01149 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Col1a2Q01149 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Col1a2Q01149 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Col1a2Q01149 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Col1a2Q01149 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Col1a2Q01149 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Col1a2Q01149 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Col1a2Q01149 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Col1a2Q01149 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Col1a2Q01149 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Col1a2Q01149 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Col1a2Q01149 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Col1a2Q01149 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Col1a2Q01149 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Col1a2Q01149 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Col1a2Q01149 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Col1a2Q01149 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Col1a2Q01149 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Col1a2Q01149 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Col1a2Q01149 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Col1a2Q01149 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Col1a2Q01149 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Col1a2Q01149 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Col1a2Q01149 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Col1a2Q01149 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Col1a2Q01149 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Col1a2Q01149 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Col1a2Q01149 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Col1a2Q01149 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Col1a2Q01149 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Col1a2Q01149 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Col1a2Q01149 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Col1a2Q01149 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Col1a2Q01149 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Col1a2Q01149 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Col1a2Q01149 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Col1a2Q01149 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Col1a2Q01149 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Col1a2Q01149 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Col1a2Q01149 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Col1a2Q01149 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Col1a2Q01149 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Col1a2Q01149 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Col1a2Q01149 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Col1a2Q01149 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Col1a2Q01149 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Col1a2Q01149 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Col1a2Q01149 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Col1a2Q01149 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Col1a2Q01149 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Col1a2Q01149 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Col1a2Q01149 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Col1a2Q01149 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Col1a2Q01149 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Col1a2Q01149 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Col1a2Q01149 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Col1a2Q01149 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Col1a2Q01149 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Col1a2Q01149 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Col1a2Q01149 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Col1a2Q01149 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Col1a2Q01149 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Col1a2Q01149 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Col1a2Q01149 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Col1a2Q01149 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Col1a2Q01149 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Col1a2Q01149 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Col1a2Q01149 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Col1a2Q01149 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Col1a2Q01149 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Col1a2Q01149 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Col1a2Q01149 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Col1a2Q01149 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Col1a2Q01149 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Col1a2Q01149 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Col1a2Q01149 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Col1a2Q01149 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Col1a2Q01149 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Col1a2Q01149 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Col1a2Q01149 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Col1a2Q01149 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Col1a2Q01149 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Col1a2Q01149 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Col1a2Q01149 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Col1a2Q01149 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Col1a2Q01149 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Col1a2Q01149 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Col1a2Q01149 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Col1a2Q01149 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Col1a2Q01149 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms