Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Grin2bQ01097 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Grin2bQ01097 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Grin2bQ01097 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Grin2bQ01097 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Grin2bQ01097 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Grin2bQ01097 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Grin2bQ01097 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Grin2bQ01097 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Grin2bQ01097 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Grin2bQ01097 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Grin2bQ01097 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Grin2bQ01097 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Grin2bQ01097 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Grin2bQ01097 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Grin2bQ01097 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Grin2bQ01097 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Grin2bQ01097 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Grin2bQ01097 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Grin2bQ01097 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Grin2bQ01097 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Grin2bQ01097 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Grin2bQ01097 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Grin2bQ01097 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Grin2bQ01097 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Grin2bQ01097 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Grin2bQ01097 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Grin2bQ01097 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Grin2bQ01097 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Grin2bQ01097 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Grin2bQ01097 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Grin2bQ01097 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Grin2bQ01097 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Grin2bQ01097 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Grin2bQ01097 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Grin2bQ01097 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Grin2bQ01097 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Grin2bQ01097 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Grin2bQ01097 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Grin2bQ01097 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Grin2bQ01097 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Grin2bQ01097 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Grin2bQ01097 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Grin2bQ01097 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Grin2bQ01097 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Grin2bQ01097 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Grin2bQ01097 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Grin2bQ01097 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Grin2bQ01097 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Grin2bQ01097 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Grin2bQ01097 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Grin2bQ01097 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Grin2bQ01097 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Grin2bQ01097 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Grin2bQ01097 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Grin2bQ01097 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Grin2bQ01097 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Grin2bQ01097 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Grin2bQ01097 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Grin2bQ01097 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Grin2bQ01097 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Grin2bQ01097 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Grin2bQ01097 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Grin2bQ01097 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Grin2bQ01097 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Grin2bQ01097 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Grin2bQ01097 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Grin2bQ01097 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Grin2bQ01097 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Grin2bQ01097 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Grin2bQ01097 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Grin2bQ01097 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Grin2bQ01097 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Grin2bQ01097 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Grin2bQ01097 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Grin2bQ01097 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Grin2bQ01097 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Grin2bQ01097 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Grin2bQ01097 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Grin2bQ01097 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Grin2bQ01097 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Grin2bQ01097 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Grin2bQ01097 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Grin2bQ01097 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Grin2bQ01097 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Grin2bQ01097 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Grin2bQ01097 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Grin2bQ01097 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Grin2bQ01097 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Grin2bQ01097 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Grin2bQ01097 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Grin2bQ01097 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Grin2bQ01097 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Grin2bQ01097 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Grin2bQ01097 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Grin2bQ01097 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Grin2bQ01097 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Grin2bQ01097 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Grin2bQ01097 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Grin2bQ01097 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms