Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gjb2Q00977 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gjb2Q00977 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gjb2Q00977 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gjb2Q00977 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gjb2Q00977 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gjb2Q00977 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gjb2Q00977 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gjb2Q00977 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gjb2Q00977 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gjb2Q00977 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gjb2Q00977 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gjb2Q00977 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gjb2Q00977 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gjb2Q00977 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gjb2Q00977 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gjb2Q00977 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Gjb2Q00977 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gjb2Q00977 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gjb2Q00977 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gjb2Q00977 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gjb2Q00977 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gjb2Q00977 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gjb2Q00977 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gjb2Q00977 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gjb2Q00977 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gjb2Q00977 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gjb2Q00977 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gjb2Q00977 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gjb2Q00977 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gjb2Q00977 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gjb2Q00977 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gjb2Q00977 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gjb2Q00977 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gjb2Q00977 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Gjb2Q00977 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gjb2Q00977 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Gjb2Q00977 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gjb2Q00977 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gjb2Q00977 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gjb2Q00977 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gjb2Q00977 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gjb2Q00977 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Gjb2Q00977 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gjb2Q00977 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gjb2Q00977 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gjb2Q00977 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gjb2Q00977 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gjb2Q00977 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gjb2Q00977 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gjb2Q00977 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gjb2Q00977 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gjb2Q00977 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gjb2Q00977 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gjb2Q00977 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gjb2Q00977 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gjb2Q00977 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gjb2Q00977 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gjb2Q00977 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gjb2Q00977 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gjb2Q00977 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gjb2Q00977 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Gjb2Q00977 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Gjb2Q00977 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Gjb2Q00977 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gjb2Q00977 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gjb2Q00977 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gjb2Q00977 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gjb2Q00977 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gjb2Q00977 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gjb2Q00977 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gjb2Q00977 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gjb2Q00977 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gjb2Q00977 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gjb2Q00977 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gjb2Q00977 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gjb2Q00977 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gjb2Q00977 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gjb2Q00977 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Gjb2Q00977 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gjb2Q00977 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gjb2Q00977 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gjb2Q00977 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gjb2Q00977 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gjb2Q00977 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gjb2Q00977 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gjb2Q00977 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gjb2Q00977 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gjb2Q00977 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gjb2Q00977 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gjb2Q00977 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Gjb2Q00977 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gjb2Q00977 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gjb2Q00977 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gjb2Q00977 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gjb2Q00977 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gjb2Q00977 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gjb2Q00977 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gjb2Q00977 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gjb2Q00977 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms