Protein–RNA interactions for Protein: Q00915

Rbp1, Retinol-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp1Q00915 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rbp1Q00915 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rbp1Q00915 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rbp1Q00915 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rbp1Q00915 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rbp1Q00915 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rbp1Q00915 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rbp1Q00915 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rbp1Q00915 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rbp1Q00915 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rbp1Q00915 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rbp1Q00915 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rbp1Q00915 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rbp1Q00915 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rbp1Q00915 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rbp1Q00915 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rbp1Q00915 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rbp1Q00915 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rbp1Q00915 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rbp1Q00915 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rbp1Q00915 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rbp1Q00915 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rbp1Q00915 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rbp1Q00915 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Rbp1Q00915 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rbp1Q00915 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rbp1Q00915 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rbp1Q00915 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rbp1Q00915 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rbp1Q00915 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rbp1Q00915 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rbp1Q00915 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rbp1Q00915 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rbp1Q00915 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rbp1Q00915 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rbp1Q00915 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rbp1Q00915 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rbp1Q00915 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rbp1Q00915 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rbp1Q00915 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rbp1Q00915 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rbp1Q00915 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rbp1Q00915 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rbp1Q00915 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rbp1Q00915 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rbp1Q00915 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rbp1Q00915 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rbp1Q00915 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Rbp1Q00915 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rbp1Q00915 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rbp1Q00915 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rbp1Q00915 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rbp1Q00915 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rbp1Q00915 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rbp1Q00915 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rbp1Q00915 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rbp1Q00915 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rbp1Q00915 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Rbp1Q00915 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rbp1Q00915 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rbp1Q00915 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rbp1Q00915 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rbp1Q00915 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rbp1Q00915 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rbp1Q00915 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rbp1Q00915 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rbp1Q00915 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rbp1Q00915 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rbp1Q00915 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rbp1Q00915 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rbp1Q00915 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rbp1Q00915 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rbp1Q00915 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rbp1Q00915 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Rbp1Q00915 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rbp1Q00915 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rbp1Q00915 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rbp1Q00915 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rbp1Q00915 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rbp1Q00915 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rbp1Q00915 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rbp1Q00915 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rbp1Q00915 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rbp1Q00915 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rbp1Q00915 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rbp1Q00915 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Rbp1Q00915 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rbp1Q00915 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rbp1Q00915 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rbp1Q00915 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rbp1Q00915 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rbp1Q00915 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rbp1Q00915 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rbp1Q00915 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rbp1Q00915 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rbp1Q00915 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rbp1Q00915 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rbp1Q00915 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rbp1Q00915 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rbp1Q00915 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms