Protein–RNA interactions for Protein: Q00724

Rbp4, Retinol-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp4Q00724 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Rbp4Q00724 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Rbp4Q00724 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Rbp4Q00724 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Rbp4Q00724 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Rbp4Q00724 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Rbp4Q00724 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Rbp4Q00724 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Rbp4Q00724 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Rbp4Q00724 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Rbp4Q00724 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Rbp4Q00724 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Rbp4Q00724 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Rbp4Q00724 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Rbp4Q00724 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Rbp4Q00724 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Rbp4Q00724 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
Rbp4Q00724 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Rbp4Q00724 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Rbp4Q00724 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Rbp4Q00724 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Rbp4Q00724 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Rbp4Q00724 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Rbp4Q00724 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Rbp4Q00724 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Rbp4Q00724 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Rbp4Q00724 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Rbp4Q00724 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Rbp4Q00724 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Rbp4Q00724 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Rbp4Q00724 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Rbp4Q00724 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Rbp4Q00724 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Rbp4Q00724 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Rbp4Q00724 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Rbp4Q00724 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Rbp4Q00724 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Rbp4Q00724 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Rbp4Q00724 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Rbp4Q00724 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Rbp4Q00724 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Rbp4Q00724 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Rbp4Q00724 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Rbp4Q00724 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Rbp4Q00724 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Rbp4Q00724 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Rbp4Q00724 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Rbp4Q00724 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Rbp4Q00724 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Rbp4Q00724 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Rbp4Q00724 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Rbp4Q00724 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Rbp4Q00724 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Rbp4Q00724 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
Rbp4Q00724 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Rbp4Q00724 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Rbp4Q00724 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Rbp4Q00724 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Rbp4Q00724 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Rbp4Q00724 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Rbp4Q00724 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Rbp4Q00724 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Rbp4Q00724 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Rbp4Q00724 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Rbp4Q00724 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Rbp4Q00724 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Rbp4Q00724 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Rbp4Q00724 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Rbp4Q00724 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Rbp4Q00724 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Rbp4Q00724 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Rbp4Q00724 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Rbp4Q00724 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Rbp4Q00724 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Rbp4Q00724 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Rbp4Q00724 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Rbp4Q00724 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Rbp4Q00724 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Rbp4Q00724 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Rbp4Q00724 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Rbp4Q00724 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Rbp4Q00724 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Rbp4Q00724 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Rbp4Q00724 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Rbp4Q00724 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Rbp4Q00724 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Rbp4Q00724 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Rbp4Q00724 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Rbp4Q00724 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Rbp4Q00724 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Rbp4Q00724 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Rbp4Q00724 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Rbp4Q00724 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Rbp4Q00724 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Rbp4Q00724 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Rbp4Q00724 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Rbp4Q00724 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Rbp4Q00724 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Rbp4Q00724 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Rbp4Q00724 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms