Protein–RNA interactions for Protein: Q00558

F8a1, Factor VIII intron 22 protein, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F8a1Q00558 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
F8a1Q00558 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
F8a1Q00558 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
F8a1Q00558 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
F8a1Q00558 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
F8a1Q00558 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
F8a1Q00558 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
F8a1Q00558 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
F8a1Q00558 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
F8a1Q00558 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
F8a1Q00558 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
F8a1Q00558 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
F8a1Q00558 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
F8a1Q00558 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
F8a1Q00558 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
F8a1Q00558 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
F8a1Q00558 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
F8a1Q00558 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
F8a1Q00558 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
F8a1Q00558 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
F8a1Q00558 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
F8a1Q00558 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
F8a1Q00558 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
F8a1Q00558 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
F8a1Q00558 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
F8a1Q00558 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
F8a1Q00558 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
F8a1Q00558 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
F8a1Q00558 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
F8a1Q00558 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
F8a1Q00558 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
F8a1Q00558 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
F8a1Q00558 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
F8a1Q00558 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
F8a1Q00558 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
F8a1Q00558 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
F8a1Q00558 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
F8a1Q00558 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
F8a1Q00558 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
F8a1Q00558 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
F8a1Q00558 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
F8a1Q00558 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
F8a1Q00558 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
F8a1Q00558 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
F8a1Q00558 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
F8a1Q00558 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
F8a1Q00558 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
F8a1Q00558 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
F8a1Q00558 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
F8a1Q00558 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
F8a1Q00558 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
F8a1Q00558 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
F8a1Q00558 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
F8a1Q00558 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
F8a1Q00558 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
F8a1Q00558 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
F8a1Q00558 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
F8a1Q00558 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
F8a1Q00558 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
F8a1Q00558 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
F8a1Q00558 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
F8a1Q00558 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
F8a1Q00558 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
F8a1Q00558 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
F8a1Q00558 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
F8a1Q00558 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
F8a1Q00558 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
F8a1Q00558 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
F8a1Q00558 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
F8a1Q00558 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
F8a1Q00558 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
F8a1Q00558 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
F8a1Q00558 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
F8a1Q00558 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
F8a1Q00558 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
F8a1Q00558 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
F8a1Q00558 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
F8a1Q00558 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
F8a1Q00558 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
F8a1Q00558 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
F8a1Q00558 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
F8a1Q00558 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
F8a1Q00558 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
F8a1Q00558 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
F8a1Q00558 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
F8a1Q00558 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
F8a1Q00558 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
F8a1Q00558 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
F8a1Q00558 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
F8a1Q00558 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
F8a1Q00558 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
F8a1Q00558 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
F8a1Q00558 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
F8a1Q00558 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
F8a1Q00558 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
F8a1Q00558 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
F8a1Q00558 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
F8a1Q00558 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
F8a1Q00558 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
F8a1Q00558 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms