Protein–RNA interactions for Protein: Q00422

Gabpa, GA-binding protein alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabpaQ00422 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GabpaQ00422 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GabpaQ00422 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GabpaQ00422 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GabpaQ00422 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GabpaQ00422 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
GabpaQ00422 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
GabpaQ00422 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
GabpaQ00422 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
GabpaQ00422 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
GabpaQ00422 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
GabpaQ00422 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GabpaQ00422 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GabpaQ00422 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GabpaQ00422 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GabpaQ00422 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GabpaQ00422 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GabpaQ00422 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GabpaQ00422 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GabpaQ00422 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GabpaQ00422 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GabpaQ00422 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GabpaQ00422 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
GabpaQ00422 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GabpaQ00422 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GabpaQ00422 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GabpaQ00422 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GabpaQ00422 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GabpaQ00422 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GabpaQ00422 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GabpaQ00422 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
GabpaQ00422 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
GabpaQ00422 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GabpaQ00422 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GabpaQ00422 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GabpaQ00422 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GabpaQ00422 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GabpaQ00422 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GabpaQ00422 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GabpaQ00422 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GabpaQ00422 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GabpaQ00422 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GabpaQ00422 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GabpaQ00422 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GabpaQ00422 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GabpaQ00422 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GabpaQ00422 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GabpaQ00422 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GabpaQ00422 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GabpaQ00422 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GabpaQ00422 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GabpaQ00422 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GabpaQ00422 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GabpaQ00422 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GabpaQ00422 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GabpaQ00422 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GabpaQ00422 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GabpaQ00422 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
GabpaQ00422 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GabpaQ00422 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GabpaQ00422 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GabpaQ00422 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GabpaQ00422 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GabpaQ00422 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GabpaQ00422 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
GabpaQ00422 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GabpaQ00422 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GabpaQ00422 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GabpaQ00422 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GabpaQ00422 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GabpaQ00422 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GabpaQ00422 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GabpaQ00422 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GabpaQ00422 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GabpaQ00422 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GabpaQ00422 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GabpaQ00422 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GabpaQ00422 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GabpaQ00422 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GabpaQ00422 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GabpaQ00422 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
GabpaQ00422 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GabpaQ00422 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GabpaQ00422 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GabpaQ00422 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GabpaQ00422 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GabpaQ00422 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GabpaQ00422 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GabpaQ00422 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GabpaQ00422 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GabpaQ00422 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GabpaQ00422 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
GabpaQ00422 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GabpaQ00422 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GabpaQ00422 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GabpaQ00422 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
GabpaQ00422 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GabpaQ00422 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GabpaQ00422 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GabpaQ00422 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms