Protein–RNA interactions for Protein: Q00288

Pax8, Paired box protein Pax-8, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax8Q00288 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pax8Q00288 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pax8Q00288 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pax8Q00288 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pax8Q00288 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pax8Q00288 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pax8Q00288 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pax8Q00288 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pax8Q00288 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pax8Q00288 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pax8Q00288 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pax8Q00288 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pax8Q00288 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pax8Q00288 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pax8Q00288 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pax8Q00288 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pax8Q00288 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pax8Q00288 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pax8Q00288 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pax8Q00288 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pax8Q00288 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pax8Q00288 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pax8Q00288 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pax8Q00288 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pax8Q00288 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pax8Q00288 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pax8Q00288 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pax8Q00288 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pax8Q00288 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Pax8Q00288 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pax8Q00288 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pax8Q00288 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pax8Q00288 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pax8Q00288 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pax8Q00288 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pax8Q00288 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pax8Q00288 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pax8Q00288 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pax8Q00288 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pax8Q00288 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Pax8Q00288 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pax8Q00288 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pax8Q00288 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Pax8Q00288 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pax8Q00288 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pax8Q00288 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pax8Q00288 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pax8Q00288 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pax8Q00288 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pax8Q00288 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pax8Q00288 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pax8Q00288 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pax8Q00288 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pax8Q00288 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pax8Q00288 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pax8Q00288 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pax8Q00288 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pax8Q00288 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pax8Q00288 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pax8Q00288 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pax8Q00288 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pax8Q00288 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pax8Q00288 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pax8Q00288 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pax8Q00288 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pax8Q00288 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pax8Q00288 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pax8Q00288 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pax8Q00288 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pax8Q00288 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Pax8Q00288 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pax8Q00288 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pax8Q00288 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pax8Q00288 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pax8Q00288 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pax8Q00288 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pax8Q00288 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pax8Q00288 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pax8Q00288 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pax8Q00288 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pax8Q00288 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pax8Q00288 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pax8Q00288 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pax8Q00288 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pax8Q00288 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pax8Q00288 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pax8Q00288 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pax8Q00288 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Pax8Q00288 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pax8Q00288 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Pax8Q00288 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Pax8Q00288 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pax8Q00288 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pax8Q00288 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pax8Q00288 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pax8Q00288 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pax8Q00288 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pax8Q00288 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pax8Q00288 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pax8Q00288 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms