Protein–RNA interactions for Protein: Q00262

Stx2, Syntaxin-2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx2Q00262 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Stx2Q00262 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Stx2Q00262 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Stx2Q00262 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Stx2Q00262 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Stx2Q00262 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Stx2Q00262 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Stx2Q00262 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Stx2Q00262 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Stx2Q00262 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Stx2Q00262 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Stx2Q00262 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Stx2Q00262 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Stx2Q00262 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Stx2Q00262 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Stx2Q00262 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Stx2Q00262 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Stx2Q00262 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Stx2Q00262 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Stx2Q00262 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Stx2Q00262 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Stx2Q00262 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Stx2Q00262 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Stx2Q00262 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Stx2Q00262 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Stx2Q00262 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Stx2Q00262 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Stx2Q00262 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Stx2Q00262 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Stx2Q00262 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Stx2Q00262 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Stx2Q00262 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Stx2Q00262 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Stx2Q00262 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Stx2Q00262 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Stx2Q00262 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Stx2Q00262 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Stx2Q00262 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Stx2Q00262 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Stx2Q00262 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Stx2Q00262 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Stx2Q00262 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Stx2Q00262 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Stx2Q00262 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Stx2Q00262 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Stx2Q00262 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Stx2Q00262 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Stx2Q00262 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Stx2Q00262 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Stx2Q00262 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Stx2Q00262 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Stx2Q00262 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Stx2Q00262 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Stx2Q00262 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Stx2Q00262 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Stx2Q00262 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Stx2Q00262 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Stx2Q00262 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Stx2Q00262 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Stx2Q00262 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Stx2Q00262 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Stx2Q00262 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Stx2Q00262 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Stx2Q00262 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Stx2Q00262 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Stx2Q00262 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Stx2Q00262 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Stx2Q00262 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Stx2Q00262 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Stx2Q00262 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Stx2Q00262 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Stx2Q00262 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Stx2Q00262 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Stx2Q00262 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Stx2Q00262 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Stx2Q00262 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Stx2Q00262 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Stx2Q00262 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Stx2Q00262 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Stx2Q00262 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Stx2Q00262 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Stx2Q00262 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Stx2Q00262 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Stx2Q00262 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Stx2Q00262 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Stx2Q00262 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Stx2Q00262 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Stx2Q00262 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Stx2Q00262 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Stx2Q00262 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Stx2Q00262 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Stx2Q00262 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Stx2Q00262 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Stx2Q00262 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Stx2Q00262 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Stx2Q00262 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Stx2Q00262 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Stx2Q00262 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Stx2Q00262 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Stx2Q00262 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms