Protein–RNA interactions for Protein: P99026

Psmb4, Proteasome subunit beta type-4, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb4P99026 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Psmb4P99026 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Psmb4P99026 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Psmb4P99026 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Psmb4P99026 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Psmb4P99026 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Psmb4P99026 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psmb4P99026 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psmb4P99026 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psmb4P99026 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Psmb4P99026 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psmb4P99026 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psmb4P99026 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psmb4P99026 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psmb4P99026 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psmb4P99026 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psmb4P99026 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Psmb4P99026 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psmb4P99026 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Psmb4P99026 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psmb4P99026 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psmb4P99026 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psmb4P99026 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Psmb4P99026 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psmb4P99026 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psmb4P99026 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psmb4P99026 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psmb4P99026 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psmb4P99026 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psmb4P99026 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psmb4P99026 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psmb4P99026 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Psmb4P99026 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psmb4P99026 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psmb4P99026 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psmb4P99026 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psmb4P99026 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psmb4P99026 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psmb4P99026 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psmb4P99026 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psmb4P99026 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psmb4P99026 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psmb4P99026 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psmb4P99026 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psmb4P99026 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.14■□□□□ 0.34
Psmb4P99026 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.14■□□□□ 0.34
Psmb4P99026 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Psmb4P99026 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Psmb4P99026 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Psmb4P99026 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Psmb4P99026 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Psmb4P99026 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Psmb4P99026 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Psmb4P99026 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Psmb4P99026 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Psmb4P99026 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Psmb4P99026 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Psmb4P99026 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Psmb4P99026 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Psmb4P99026 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Psmb4P99026 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Psmb4P99026 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Psmb4P99026 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Psmb4P99026 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Psmb4P99026 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Psmb4P99026 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psmb4P99026 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psmb4P99026 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psmb4P99026 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psmb4P99026 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psmb4P99026 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psmb4P99026 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psmb4P99026 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psmb4P99026 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psmb4P99026 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psmb4P99026 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psmb4P99026 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psmb4P99026 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psmb4P99026 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psmb4P99026 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psmb4P99026 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Psmb4P99026 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Psmb4P99026 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Psmb4P99026 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Psmb4P99026 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Psmb4P99026 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Psmb4P99026 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Psmb4P99026 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Psmb4P99026 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Psmb4P99026 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Psmb4P99026 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Psmb4P99026 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Psmb4P99026 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Psmb4P99026 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Psmb4P99026 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Psmb4P99026 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Psmb4P99026 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Psmb4P99026 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Psmb4P99026 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Psmb4P99026 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms