Protein–RNA interactions for Protein: P97929

Brca2, Breast cancer type 2 susceptibility protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 3,329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brca2P97929 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Brca2P97929 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Brca2P97929 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Brca2P97929 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Brca2P97929 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Brca2P97929 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Brca2P97929 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Brca2P97929 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Brca2P97929 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Brca2P97929 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Brca2P97929 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Brca2P97929 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Brca2P97929 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Brca2P97929 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Brca2P97929 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Brca2P97929 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Brca2P97929 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Brca2P97929 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Brca2P97929 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Brca2P97929 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Brca2P97929 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Brca2P97929 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Brca2P97929 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Brca2P97929 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Brca2P97929 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Brca2P97929 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Brca2P97929 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Brca2P97929 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Brca2P97929 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Brca2P97929 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Brca2P97929 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Brca2P97929 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Brca2P97929 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Brca2P97929 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Brca2P97929 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Brca2P97929 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Brca2P97929 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Brca2P97929 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Brca2P97929 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Brca2P97929 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Brca2P97929 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Brca2P97929 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Brca2P97929 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Brca2P97929 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Brca2P97929 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Brca2P97929 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Brca2P97929 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Brca2P97929 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Brca2P97929 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Brca2P97929 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Brca2P97929 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Brca2P97929 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Brca2P97929 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Brca2P97929 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Brca2P97929 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Brca2P97929 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Brca2P97929 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Brca2P97929 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Brca2P97929 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Brca2P97929 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Brca2P97929 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Brca2P97929 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Brca2P97929 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Brca2P97929 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Brca2P97929 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Brca2P97929 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Brca2P97929 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Brca2P97929 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Brca2P97929 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Brca2P97929 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Brca2P97929 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Brca2P97929 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Brca2P97929 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Brca2P97929 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Brca2P97929 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Brca2P97929 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Brca2P97929 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Brca2P97929 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Brca2P97929 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Brca2P97929 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Brca2P97929 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Brca2P97929 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Brca2P97929 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Brca2P97929 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Brca2P97929 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Brca2P97929 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Brca2P97929 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Brca2P97929 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Brca2P97929 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Brca2P97929 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Brca2P97929 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Brca2P97929 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Brca2P97929 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Brca2P97929 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Brca2P97929 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Brca2P97929 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Brca2P97929 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Brca2P97929 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Brca2P97929 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Brca2P97929 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms