Protein–RNA interactions for Protein: P97784

Cry1, Cryptochrome-1, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cry1P97784 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cry1P97784 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cry1P97784 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cry1P97784 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cry1P97784 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Cry1P97784 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cry1P97784 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cry1P97784 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cry1P97784 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cry1P97784 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cry1P97784 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cry1P97784 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cry1P97784 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cry1P97784 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cry1P97784 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cry1P97784 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cry1P97784 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cry1P97784 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cry1P97784 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cry1P97784 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cry1P97784 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cry1P97784 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cry1P97784 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cry1P97784 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cry1P97784 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Cry1P97784 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cry1P97784 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cry1P97784 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cry1P97784 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cry1P97784 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cry1P97784 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cry1P97784 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cry1P97784 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cry1P97784 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cry1P97784 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cry1P97784 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cry1P97784 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cry1P97784 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cry1P97784 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cry1P97784 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cry1P97784 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Cry1P97784 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cry1P97784 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Cry1P97784 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cry1P97784 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cry1P97784 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cry1P97784 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cry1P97784 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cry1P97784 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cry1P97784 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cry1P97784 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cry1P97784 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cry1P97784 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cry1P97784 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cry1P97784 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cry1P97784 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cry1P97784 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cry1P97784 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cry1P97784 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cry1P97784 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cry1P97784 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cry1P97784 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Cry1P97784 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cry1P97784 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cry1P97784 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Cry1P97784 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cry1P97784 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cry1P97784 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cry1P97784 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cry1P97784 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cry1P97784 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cry1P97784 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Cry1P97784 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cry1P97784 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Cry1P97784 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cry1P97784 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cry1P97784 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cry1P97784 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cry1P97784 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cry1P97784 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cry1P97784 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cry1P97784 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cry1P97784 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cry1P97784 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cry1P97784 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cry1P97784 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cry1P97784 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cry1P97784 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cry1P97784 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cry1P97784 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cry1P97784 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cry1P97784 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cry1P97784 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cry1P97784 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cry1P97784 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cry1P97784 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cry1P97784 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cry1P97784 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cry1P97784 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cry1P97784 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms