Protein–RNA interactions for Protein: P97468

Cmklr1, Chemokine-like receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmklr1P97468 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cmklr1P97468 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cmklr1P97468 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cmklr1P97468 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cmklr1P97468 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cmklr1P97468 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cmklr1P97468 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cmklr1P97468 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cmklr1P97468 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cmklr1P97468 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cmklr1P97468 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cmklr1P97468 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cmklr1P97468 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cmklr1P97468 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cmklr1P97468 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cmklr1P97468 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cmklr1P97468 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cmklr1P97468 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cmklr1P97468 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cmklr1P97468 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cmklr1P97468 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cmklr1P97468 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cmklr1P97468 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cmklr1P97468 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cmklr1P97468 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cmklr1P97468 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cmklr1P97468 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cmklr1P97468 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cmklr1P97468 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cmklr1P97468 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cmklr1P97468 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cmklr1P97468 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cmklr1P97468 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cmklr1P97468 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cmklr1P97468 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cmklr1P97468 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cmklr1P97468 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cmklr1P97468 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cmklr1P97468 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cmklr1P97468 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cmklr1P97468 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cmklr1P97468 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cmklr1P97468 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cmklr1P97468 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cmklr1P97468 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cmklr1P97468 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cmklr1P97468 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cmklr1P97468 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cmklr1P97468 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cmklr1P97468 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cmklr1P97468 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cmklr1P97468 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cmklr1P97468 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cmklr1P97468 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cmklr1P97468 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cmklr1P97468 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Cmklr1P97468 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cmklr1P97468 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cmklr1P97468 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Cmklr1P97468 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Cmklr1P97468 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cmklr1P97468 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cmklr1P97468 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cmklr1P97468 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cmklr1P97468 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cmklr1P97468 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cmklr1P97468 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cmklr1P97468 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cmklr1P97468 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cmklr1P97468 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cmklr1P97468 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cmklr1P97468 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cmklr1P97468 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cmklr1P97468 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cmklr1P97468 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cmklr1P97468 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Cmklr1P97468 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cmklr1P97468 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cmklr1P97468 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Cmklr1P97468 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cmklr1P97468 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cmklr1P97468 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cmklr1P97468 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cmklr1P97468 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cmklr1P97468 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cmklr1P97468 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cmklr1P97468 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cmklr1P97468 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cmklr1P97468 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cmklr1P97468 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cmklr1P97468 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cmklr1P97468 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cmklr1P97468 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Cmklr1P97468 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cmklr1P97468 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cmklr1P97468 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cmklr1P97468 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cmklr1P97468 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cmklr1P97468 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cmklr1P97468 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms