Protein–RNA interactions for Protein: P97432

Nbr1, Next to BRCA1 gene 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 988 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nbr1P97432 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nbr1P97432 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Nbr1P97432 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nbr1P97432 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Nbr1P97432 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Nbr1P97432 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nbr1P97432 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Nbr1P97432 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nbr1P97432 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nbr1P97432 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nbr1P97432 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nbr1P97432 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nbr1P97432 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nbr1P97432 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nbr1P97432 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Nbr1P97432 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nbr1P97432 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nbr1P97432 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nbr1P97432 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nbr1P97432 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nbr1P97432 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nbr1P97432 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nbr1P97432 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nbr1P97432 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nbr1P97432 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nbr1P97432 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nbr1P97432 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nbr1P97432 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nbr1P97432 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nbr1P97432 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nbr1P97432 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Nbr1P97432 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nbr1P97432 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Nbr1P97432 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Nbr1P97432 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nbr1P97432 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nbr1P97432 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nbr1P97432 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nbr1P97432 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nbr1P97432 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nbr1P97432 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nbr1P97432 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nbr1P97432 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nbr1P97432 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nbr1P97432 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nbr1P97432 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nbr1P97432 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nbr1P97432 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nbr1P97432 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nbr1P97432 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nbr1P97432 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nbr1P97432 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nbr1P97432 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nbr1P97432 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nbr1P97432 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nbr1P97432 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nbr1P97432 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nbr1P97432 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nbr1P97432 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nbr1P97432 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Nbr1P97432 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Nbr1P97432 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Nbr1P97432 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nbr1P97432 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nbr1P97432 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nbr1P97432 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nbr1P97432 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nbr1P97432 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nbr1P97432 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nbr1P97432 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nbr1P97432 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Nbr1P97432 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nbr1P97432 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nbr1P97432 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nbr1P97432 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nbr1P97432 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nbr1P97432 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nbr1P97432 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nbr1P97432 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nbr1P97432 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nbr1P97432 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nbr1P97432 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nbr1P97432 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nbr1P97432 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nbr1P97432 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nbr1P97432 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nbr1P97432 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nbr1P97432 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nbr1P97432 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nbr1P97432 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Nbr1P97432 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nbr1P97432 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nbr1P97432 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nbr1P97432 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nbr1P97432 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nbr1P97432 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nbr1P97432 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nbr1P97432 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nbr1P97432 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nbr1P97432 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms