Protein–RNA interactions for Protein: P97358

Taf1b, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1bP97358 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Taf1bP97358 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Taf1bP97358 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Taf1bP97358 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Taf1bP97358 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Taf1bP97358 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Taf1bP97358 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Taf1bP97358 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Taf1bP97358 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Taf1bP97358 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Taf1bP97358 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Taf1bP97358 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Taf1bP97358 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Taf1bP97358 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Taf1bP97358 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Taf1bP97358 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Taf1bP97358 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Taf1bP97358 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Taf1bP97358 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Taf1bP97358 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Taf1bP97358 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Taf1bP97358 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Taf1bP97358 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Taf1bP97358 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Taf1bP97358 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Taf1bP97358 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Taf1bP97358 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Taf1bP97358 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Taf1bP97358 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Taf1bP97358 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Taf1bP97358 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Taf1bP97358 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Taf1bP97358 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Taf1bP97358 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Taf1bP97358 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Taf1bP97358 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Taf1bP97358 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Taf1bP97358 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Taf1bP97358 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Taf1bP97358 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Taf1bP97358 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Taf1bP97358 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Taf1bP97358 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Taf1bP97358 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Taf1bP97358 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Taf1bP97358 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Taf1bP97358 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Taf1bP97358 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Taf1bP97358 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Taf1bP97358 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Taf1bP97358 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Taf1bP97358 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Taf1bP97358 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Taf1bP97358 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Taf1bP97358 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Taf1bP97358 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Taf1bP97358 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Taf1bP97358 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Taf1bP97358 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Taf1bP97358 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Taf1bP97358 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Taf1bP97358 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Taf1bP97358 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Taf1bP97358 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Taf1bP97358 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Taf1bP97358 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Taf1bP97358 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Taf1bP97358 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Taf1bP97358 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Taf1bP97358 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Taf1bP97358 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Taf1bP97358 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Taf1bP97358 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Taf1bP97358 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Taf1bP97358 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Taf1bP97358 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Taf1bP97358 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Taf1bP97358 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Taf1bP97358 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Taf1bP97358 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Taf1bP97358 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Taf1bP97358 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Taf1bP97358 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Taf1bP97358 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Taf1bP97358 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Taf1bP97358 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Taf1bP97358 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Taf1bP97358 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Taf1bP97358 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Taf1bP97358 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Taf1bP97358 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Taf1bP97358 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Taf1bP97358 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Taf1bP97358 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Taf1bP97358 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Taf1bP97358 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Taf1bP97358 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Taf1bP97358 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Taf1bP97358 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Taf1bP97358 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms