Protein–RNA interactions for Protein: P97334

Nkx2-3, Homeobox protein Nkx-2.3, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx2-3P97334 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nkx2-3P97334 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Nkx2-3P97334 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nkx2-3P97334 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nkx2-3P97334 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nkx2-3P97334 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nkx2-3P97334 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nkx2-3P97334 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nkx2-3P97334 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nkx2-3P97334 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nkx2-3P97334 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nkx2-3P97334 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nkx2-3P97334 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nkx2-3P97334 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nkx2-3P97334 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nkx2-3P97334 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nkx2-3P97334 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nkx2-3P97334 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nkx2-3P97334 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nkx2-3P97334 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nkx2-3P97334 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nkx2-3P97334 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nkx2-3P97334 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nkx2-3P97334 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nkx2-3P97334 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nkx2-3P97334 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nkx2-3P97334 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nkx2-3P97334 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nkx2-3P97334 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nkx2-3P97334 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nkx2-3P97334 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nkx2-3P97334 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nkx2-3P97334 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nkx2-3P97334 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nkx2-3P97334 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Nkx2-3P97334 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nkx2-3P97334 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nkx2-3P97334 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nkx2-3P97334 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nkx2-3P97334 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nkx2-3P97334 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nkx2-3P97334 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nkx2-3P97334 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nkx2-3P97334 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nkx2-3P97334 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nkx2-3P97334 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nkx2-3P97334 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nkx2-3P97334 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nkx2-3P97334 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nkx2-3P97334 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nkx2-3P97334 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nkx2-3P97334 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nkx2-3P97334 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nkx2-3P97334 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nkx2-3P97334 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nkx2-3P97334 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nkx2-3P97334 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nkx2-3P97334 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nkx2-3P97334 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nkx2-3P97334 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nkx2-3P97334 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nkx2-3P97334 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nkx2-3P97334 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Nkx2-3P97334 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nkx2-3P97334 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nkx2-3P97334 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nkx2-3P97334 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nkx2-3P97334 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nkx2-3P97334 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nkx2-3P97334 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nkx2-3P97334 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nkx2-3P97334 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nkx2-3P97334 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nkx2-3P97334 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nkx2-3P97334 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nkx2-3P97334 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nkx2-3P97334 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nkx2-3P97334 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nkx2-3P97334 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nkx2-3P97334 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nkx2-3P97334 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nkx2-3P97334 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Nkx2-3P97334 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nkx2-3P97334 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nkx2-3P97334 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nkx2-3P97334 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nkx2-3P97334 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nkx2-3P97334 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nkx2-3P97334 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nkx2-3P97334 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nkx2-3P97334 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nkx2-3P97334 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nkx2-3P97334 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nkx2-3P97334 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nkx2-3P97334 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nkx2-3P97334 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nkx2-3P97334 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nkx2-3P97334 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Nkx2-3P97334 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nkx2-3P97334 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms