Protein–RNA interactions for Protein: P70700

Polr1b, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1bP70700 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Polr1bP70700 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Polr1bP70700 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Polr1bP70700 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Polr1bP70700 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Polr1bP70700 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Polr1bP70700 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Polr1bP70700 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Polr1bP70700 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Polr1bP70700 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Polr1bP70700 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Polr1bP70700 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Polr1bP70700 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Polr1bP70700 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Polr1bP70700 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Polr1bP70700 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Polr1bP70700 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Polr1bP70700 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Polr1bP70700 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Polr1bP70700 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Polr1bP70700 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Polr1bP70700 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Polr1bP70700 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Polr1bP70700 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Polr1bP70700 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Polr1bP70700 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Polr1bP70700 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Polr1bP70700 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Polr1bP70700 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Polr1bP70700 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Polr1bP70700 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Polr1bP70700 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Polr1bP70700 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Polr1bP70700 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Polr1bP70700 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Polr1bP70700 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Polr1bP70700 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Polr1bP70700 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Polr1bP70700 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Polr1bP70700 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Polr1bP70700 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Polr1bP70700 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Polr1bP70700 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Polr1bP70700 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Polr1bP70700 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Polr1bP70700 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Polr1bP70700 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Polr1bP70700 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Polr1bP70700 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Polr1bP70700 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Polr1bP70700 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Polr1bP70700 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Polr1bP70700 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Polr1bP70700 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Polr1bP70700 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Polr1bP70700 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Polr1bP70700 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Polr1bP70700 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Polr1bP70700 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Polr1bP70700 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Polr1bP70700 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Polr1bP70700 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Polr1bP70700 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Polr1bP70700 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Polr1bP70700 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Polr1bP70700 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Polr1bP70700 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Polr1bP70700 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Polr1bP70700 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Polr1bP70700 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Polr1bP70700 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Polr1bP70700 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Polr1bP70700 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Polr1bP70700 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Polr1bP70700 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Polr1bP70700 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Polr1bP70700 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Polr1bP70700 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Polr1bP70700 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Polr1bP70700 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Polr1bP70700 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Polr1bP70700 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Polr1bP70700 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Polr1bP70700 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Polr1bP70700 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Polr1bP70700 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Polr1bP70700 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Polr1bP70700 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Polr1bP70700 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Polr1bP70700 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Polr1bP70700 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Polr1bP70700 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Polr1bP70700 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Polr1bP70700 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Polr1bP70700 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Polr1bP70700 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Polr1bP70700 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Polr1bP70700 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Polr1bP70700 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Polr1bP70700 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms