Protein–RNA interactions for Protein: P70354

Msx3, Homeobox protein MSX-3, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx3P70354 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Msx3P70354 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Msx3P70354 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Msx3P70354 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Msx3P70354 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Msx3P70354 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Msx3P70354 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Msx3P70354 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Msx3P70354 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Msx3P70354 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Msx3P70354 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Msx3P70354 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Msx3P70354 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Msx3P70354 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Msx3P70354 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Msx3P70354 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Msx3P70354 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Msx3P70354 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Msx3P70354 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Msx3P70354 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Msx3P70354 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Msx3P70354 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Msx3P70354 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Msx3P70354 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Msx3P70354 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Msx3P70354 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Msx3P70354 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Msx3P70354 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Msx3P70354 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Msx3P70354 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Msx3P70354 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Msx3P70354 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Msx3P70354 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Msx3P70354 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Msx3P70354 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Msx3P70354 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Msx3P70354 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Msx3P70354 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Msx3P70354 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Msx3P70354 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Msx3P70354 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Msx3P70354 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Msx3P70354 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Msx3P70354 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Msx3P70354 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Msx3P70354 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Msx3P70354 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Msx3P70354 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Msx3P70354 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Msx3P70354 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Msx3P70354 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Msx3P70354 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Msx3P70354 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Msx3P70354 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Msx3P70354 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Msx3P70354 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Msx3P70354 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Msx3P70354 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Msx3P70354 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Msx3P70354 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Msx3P70354 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Msx3P70354 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Msx3P70354 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Msx3P70354 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Msx3P70354 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Msx3P70354 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Msx3P70354 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Msx3P70354 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Msx3P70354 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Msx3P70354 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Msx3P70354 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Msx3P70354 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Msx3P70354 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Msx3P70354 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Msx3P70354 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Msx3P70354 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Msx3P70354 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Msx3P70354 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Msx3P70354 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Msx3P70354 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Msx3P70354 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Msx3P70354 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Msx3P70354 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Msx3P70354 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Msx3P70354 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Msx3P70354 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Msx3P70354 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Msx3P70354 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Msx3P70354 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Msx3P70354 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Msx3P70354 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Msx3P70354 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Msx3P70354 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Msx3P70354 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Msx3P70354 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Msx3P70354 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Msx3P70354 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Msx3P70354 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Msx3P70354 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Msx3P70354 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms