Protein–RNA interactions for Protein: P70327

Tbx6, T-box transcription factor TBX6, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbx6P70327 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tbx6P70327 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tbx6P70327 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tbx6P70327 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tbx6P70327 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tbx6P70327 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tbx6P70327 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tbx6P70327 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tbx6P70327 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tbx6P70327 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tbx6P70327 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tbx6P70327 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tbx6P70327 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tbx6P70327 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tbx6P70327 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tbx6P70327 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tbx6P70327 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tbx6P70327 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tbx6P70327 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tbx6P70327 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tbx6P70327 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tbx6P70327 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tbx6P70327 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tbx6P70327 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tbx6P70327 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tbx6P70327 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tbx6P70327 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Tbx6P70327 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tbx6P70327 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tbx6P70327 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tbx6P70327 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tbx6P70327 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tbx6P70327 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tbx6P70327 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tbx6P70327 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tbx6P70327 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tbx6P70327 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tbx6P70327 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tbx6P70327 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tbx6P70327 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tbx6P70327 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tbx6P70327 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tbx6P70327 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Tbx6P70327 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tbx6P70327 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tbx6P70327 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tbx6P70327 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tbx6P70327 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tbx6P70327 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tbx6P70327 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tbx6P70327 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tbx6P70327 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tbx6P70327 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tbx6P70327 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tbx6P70327 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tbx6P70327 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tbx6P70327 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tbx6P70327 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tbx6P70327 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tbx6P70327 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tbx6P70327 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tbx6P70327 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tbx6P70327 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tbx6P70327 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tbx6P70327 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tbx6P70327 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tbx6P70327 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tbx6P70327 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tbx6P70327 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tbx6P70327 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tbx6P70327 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tbx6P70327 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tbx6P70327 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tbx6P70327 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tbx6P70327 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tbx6P70327 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tbx6P70327 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tbx6P70327 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tbx6P70327 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tbx6P70327 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tbx6P70327 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tbx6P70327 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tbx6P70327 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tbx6P70327 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tbx6P70327 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tbx6P70327 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tbx6P70327 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tbx6P70327 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tbx6P70327 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tbx6P70327 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tbx6P70327 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tbx6P70327 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Tbx6P70327 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Tbx6P70327 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tbx6P70327 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tbx6P70327 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tbx6P70327 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tbx6P70327 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tbx6P70327 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tbx6P70327 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms