Protein–RNA interactions for Protein: P70321

Hoxb13, Homeobox protein Hox-B13, mousemouse

Predictions only

Length 286 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb13P70321 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxb13P70321 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxb13P70321 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxb13P70321 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxb13P70321 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxb13P70321 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxb13P70321 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxb13P70321 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxb13P70321 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxb13P70321 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxb13P70321 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxb13P70321 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxb13P70321 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxb13P70321 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxb13P70321 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxb13P70321 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxb13P70321 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxb13P70321 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxb13P70321 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxb13P70321 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxb13P70321 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxb13P70321 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxb13P70321 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxb13P70321 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Hoxb13P70321 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Hoxb13P70321 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Hoxb13P70321 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hoxb13P70321 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hoxb13P70321 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hoxb13P70321 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hoxb13P70321 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hoxb13P70321 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hoxb13P70321 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hoxb13P70321 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hoxb13P70321 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxb13P70321 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxb13P70321 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxb13P70321 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxb13P70321 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxb13P70321 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxb13P70321 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxb13P70321 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxb13P70321 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxb13P70321 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxb13P70321 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxb13P70321 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxb13P70321 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxb13P70321 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxb13P70321 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxb13P70321 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxb13P70321 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxb13P70321 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxb13P70321 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxb13P70321 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxb13P70321 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxb13P70321 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxb13P70321 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxb13P70321 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxb13P70321 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxb13P70321 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxb13P70321 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxb13P70321 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxb13P70321 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxb13P70321 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxb13P70321 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxb13P70321 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxb13P70321 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxb13P70321 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxb13P70321 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxb13P70321 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxb13P70321 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxb13P70321 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxb13P70321 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxb13P70321 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxb13P70321 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxb13P70321 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxb13P70321 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxb13P70321 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxb13P70321 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxb13P70321 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxb13P70321 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxb13P70321 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxb13P70321 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxb13P70321 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxb13P70321 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxb13P70321 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxb13P70321 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxb13P70321 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxb13P70321 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxb13P70321 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxb13P70321 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxb13P70321 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxb13P70321 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxb13P70321 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxb13P70321 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxb13P70321 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxb13P70321 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxb13P70321 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxb13P70321 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxb13P70321 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms