Protein–RNA interactions for Protein: P70279

Surf6, Surfeit locus protein 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf6P70279 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Surf6P70279 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Surf6P70279 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Surf6P70279 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Surf6P70279 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Surf6P70279 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Surf6P70279 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Surf6P70279 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Surf6P70279 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Surf6P70279 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Surf6P70279 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Surf6P70279 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Surf6P70279 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Surf6P70279 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Surf6P70279 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Surf6P70279 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Surf6P70279 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Surf6P70279 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Surf6P70279 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Surf6P70279 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Surf6P70279 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Surf6P70279 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Surf6P70279 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Surf6P70279 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Surf6P70279 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Surf6P70279 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Surf6P70279 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Surf6P70279 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Surf6P70279 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Surf6P70279 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Surf6P70279 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Surf6P70279 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Surf6P70279 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Surf6P70279 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Surf6P70279 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Surf6P70279 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Surf6P70279 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Surf6P70279 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Surf6P70279 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Surf6P70279 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Surf6P70279 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Surf6P70279 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Surf6P70279 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Surf6P70279 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Surf6P70279 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Surf6P70279 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Surf6P70279 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Surf6P70279 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Surf6P70279 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Surf6P70279 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Surf6P70279 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Surf6P70279 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Surf6P70279 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Surf6P70279 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Surf6P70279 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Surf6P70279 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Surf6P70279 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Surf6P70279 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Surf6P70279 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Surf6P70279 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Surf6P70279 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Surf6P70279 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Surf6P70279 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Surf6P70279 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Surf6P70279 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Surf6P70279 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Surf6P70279 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Surf6P70279 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Surf6P70279 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Surf6P70279 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Surf6P70279 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Surf6P70279 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Surf6P70279 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Surf6P70279 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Surf6P70279 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Surf6P70279 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Surf6P70279 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Surf6P70279 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Surf6P70279 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Surf6P70279 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Surf6P70279 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Surf6P70279 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Surf6P70279 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Surf6P70279 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Surf6P70279 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Surf6P70279 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Surf6P70279 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Surf6P70279 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Surf6P70279 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Surf6P70279 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Surf6P70279 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Surf6P70279 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Surf6P70279 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Surf6P70279 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Surf6P70279 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Surf6P70279 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Surf6P70279 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Surf6P70279 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Surf6P70279 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Surf6P70279 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms