Protein–RNA interactions for Protein: P70270

Rad54l, DNA repair and recombination protein RAD54-like, mousemouse

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad54lP70270 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rad54lP70270 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rad54lP70270 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rad54lP70270 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rad54lP70270 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rad54lP70270 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Rad54lP70270 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rad54lP70270 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Rad54lP70270 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rad54lP70270 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rad54lP70270 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rad54lP70270 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rad54lP70270 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rad54lP70270 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rad54lP70270 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rad54lP70270 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rad54lP70270 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rad54lP70270 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rad54lP70270 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rad54lP70270 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rad54lP70270 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rad54lP70270 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rad54lP70270 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rad54lP70270 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rad54lP70270 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rad54lP70270 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rad54lP70270 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rad54lP70270 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rad54lP70270 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rad54lP70270 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rad54lP70270 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rad54lP70270 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rad54lP70270 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rad54lP70270 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rad54lP70270 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rad54lP70270 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rad54lP70270 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rad54lP70270 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rad54lP70270 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rad54lP70270 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rad54lP70270 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rad54lP70270 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rad54lP70270 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rad54lP70270 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rad54lP70270 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rad54lP70270 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rad54lP70270 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rad54lP70270 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rad54lP70270 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rad54lP70270 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rad54lP70270 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rad54lP70270 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rad54lP70270 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rad54lP70270 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rad54lP70270 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rad54lP70270 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rad54lP70270 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rad54lP70270 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rad54lP70270 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rad54lP70270 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rad54lP70270 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rad54lP70270 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rad54lP70270 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rad54lP70270 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rad54lP70270 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rad54lP70270 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rad54lP70270 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rad54lP70270 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rad54lP70270 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rad54lP70270 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rad54lP70270 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Rad54lP70270 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rad54lP70270 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rad54lP70270 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rad54lP70270 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rad54lP70270 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rad54lP70270 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rad54lP70270 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rad54lP70270 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rad54lP70270 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rad54lP70270 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rad54lP70270 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rad54lP70270 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rad54lP70270 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rad54lP70270 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rad54lP70270 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rad54lP70270 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rad54lP70270 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rad54lP70270 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rad54lP70270 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rad54lP70270 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rad54lP70270 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rad54lP70270 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rad54lP70270 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rad54lP70270 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rad54lP70270 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rad54lP70270 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rad54lP70270 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rad54lP70270 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rad54lP70270 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms