Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxd13P70217 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxd13P70217 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxd13P70217 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxd13P70217 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxd13P70217 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxd13P70217 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxd13P70217 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxd13P70217 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxd13P70217 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxd13P70217 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxd13P70217 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxd13P70217 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxd13P70217 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxd13P70217 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxd13P70217 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxd13P70217 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxd13P70217 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Hoxd13P70217 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Hoxd13P70217 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxd13P70217 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxd13P70217 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxd13P70217 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxd13P70217 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxd13P70217 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxd13P70217 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxd13P70217 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxd13P70217 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxd13P70217 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxd13P70217 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxd13P70217 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxd13P70217 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxd13P70217 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxd13P70217 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxd13P70217 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxd13P70217 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxd13P70217 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxd13P70217 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxd13P70217 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxd13P70217 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxd13P70217 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxd13P70217 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxd13P70217 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxd13P70217 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxd13P70217 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxd13P70217 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxd13P70217 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxd13P70217 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxd13P70217 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxd13P70217 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxd13P70217 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hoxd13P70217 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hoxd13P70217 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hoxd13P70217 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hoxd13P70217 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hoxd13P70217 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hoxd13P70217 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hoxd13P70217 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hoxd13P70217 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hoxd13P70217 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hoxd13P70217 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Hoxd13P70217 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hoxd13P70217 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hoxd13P70217 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hoxd13P70217 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hoxd13P70217 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hoxd13P70217 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hoxd13P70217 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hoxd13P70217 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hoxd13P70217 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hoxd13P70217 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hoxd13P70217 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hoxd13P70217 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hoxd13P70217 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hoxd13P70217 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hoxd13P70217 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hoxd13P70217 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hoxd13P70217 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hoxd13P70217 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hoxd13P70217 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hoxd13P70217 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hoxd13P70217 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hoxd13P70217 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hoxd13P70217 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Hoxd13P70217 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hoxd13P70217 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hoxd13P70217 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hoxd13P70217 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hoxd13P70217 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hoxd13P70217 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Hoxd13P70217 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hoxd13P70217 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hoxd13P70217 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hoxd13P70217 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hoxd13P70217 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hoxd13P70217 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hoxd13P70217 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hoxd13P70217 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hoxd13P70217 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hoxd13P70217 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms