Protein–RNA interactions for Protein: P62965

Crabp1, Cellular retinoic acid-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crabp1P62965 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Crabp1P62965 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Crabp1P62965 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Crabp1P62965 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Crabp1P62965 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Crabp1P62965 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Crabp1P62965 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Crabp1P62965 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Crabp1P62965 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Crabp1P62965 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Crabp1P62965 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Crabp1P62965 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Crabp1P62965 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Crabp1P62965 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Crabp1P62965 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Crabp1P62965 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Crabp1P62965 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Crabp1P62965 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Crabp1P62965 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Crabp1P62965 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Crabp1P62965 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Crabp1P62965 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Crabp1P62965 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Crabp1P62965 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Crabp1P62965 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Crabp1P62965 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Crabp1P62965 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Crabp1P62965 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Crabp1P62965 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Crabp1P62965 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Crabp1P62965 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Crabp1P62965 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Crabp1P62965 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Crabp1P62965 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Crabp1P62965 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Crabp1P62965 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Crabp1P62965 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Crabp1P62965 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Crabp1P62965 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Crabp1P62965 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Crabp1P62965 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Crabp1P62965 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Crabp1P62965 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Crabp1P62965 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Crabp1P62965 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Crabp1P62965 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Crabp1P62965 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Crabp1P62965 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Crabp1P62965 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Crabp1P62965 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Crabp1P62965 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Crabp1P62965 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Crabp1P62965 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Crabp1P62965 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Crabp1P62965 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Crabp1P62965 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Crabp1P62965 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Crabp1P62965 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Crabp1P62965 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Crabp1P62965 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Crabp1P62965 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Crabp1P62965 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Crabp1P62965 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Crabp1P62965 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Crabp1P62965 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Crabp1P62965 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Crabp1P62965 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Crabp1P62965 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Crabp1P62965 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Crabp1P62965 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Crabp1P62965 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Crabp1P62965 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Crabp1P62965 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Crabp1P62965 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Crabp1P62965 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Crabp1P62965 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Crabp1P62965 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Crabp1P62965 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Crabp1P62965 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Crabp1P62965 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Crabp1P62965 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Crabp1P62965 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Crabp1P62965 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Crabp1P62965 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Crabp1P62965 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Crabp1P62965 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Crabp1P62965 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Crabp1P62965 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Crabp1P62965 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Crabp1P62965 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Crabp1P62965 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Crabp1P62965 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Crabp1P62965 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Crabp1P62965 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Crabp1P62965 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Crabp1P62965 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Crabp1P62965 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Crabp1P62965 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Crabp1P62965 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Crabp1P62965 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms