Protein–RNA interactions for Protein: P62852

Rps25, 40S ribosomal protein S25, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps25P62852 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rps25P62852 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rps25P62852 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rps25P62852 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rps25P62852 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rps25P62852 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rps25P62852 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rps25P62852 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rps25P62852 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rps25P62852 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rps25P62852 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rps25P62852 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rps25P62852 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rps25P62852 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rps25P62852 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rps25P62852 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rps25P62852 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rps25P62852 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rps25P62852 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rps25P62852 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rps25P62852 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rps25P62852 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rps25P62852 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rps25P62852 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rps25P62852 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rps25P62852 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rps25P62852 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rps25P62852 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rps25P62852 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rps25P62852 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rps25P62852 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rps25P62852 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rps25P62852 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rps25P62852 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rps25P62852 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rps25P62852 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rps25P62852 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rps25P62852 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rps25P62852 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rps25P62852 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rps25P62852 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rps25P62852 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rps25P62852 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rps25P62852 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rps25P62852 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rps25P62852 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rps25P62852 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rps25P62852 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rps25P62852 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rps25P62852 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rps25P62852 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rps25P62852 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rps25P62852 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rps25P62852 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rps25P62852 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rps25P62852 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rps25P62852 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rps25P62852 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rps25P62852 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rps25P62852 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rps25P62852 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rps25P62852 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rps25P62852 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rps25P62852 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rps25P62852 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rps25P62852 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rps25P62852 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rps25P62852 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rps25P62852 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rps25P62852 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rps25P62852 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rps25P62852 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rps25P62852 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rps25P62852 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rps25P62852 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rps25P62852 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rps25P62852 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rps25P62852 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rps25P62852 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rps25P62852 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rps25P62852 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rps25P62852 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rps25P62852 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rps25P62852 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rps25P62852 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rps25P62852 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rps25P62852 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rps25P62852 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rps25P62852 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rps25P62852 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rps25P62852 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rps25P62852 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rps25P62852 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rps25P62852 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rps25P62852 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rps25P62852 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rps25P62852 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rps25P62852 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rps25P62852 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rps25P62852 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms