Protein–RNA interactions for Protein: P62821

Rab1A, Ras-related protein Rab-1A, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab1AP62821 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab1AP62821 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab1AP62821 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Rab1AP62821 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab1AP62821 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab1AP62821 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab1AP62821 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab1AP62821 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab1AP62821 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rab1AP62821 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab1AP62821 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Rab1AP62821 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rab1AP62821 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab1AP62821 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab1AP62821 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab1AP62821 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab1AP62821 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab1AP62821 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab1AP62821 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab1AP62821 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab1AP62821 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Rab1AP62821 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Rab1AP62821 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab1AP62821 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Rab1AP62821 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab1AP62821 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab1AP62821 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Rab1AP62821 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab1AP62821 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab1AP62821 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab1AP62821 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab1AP62821 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rab1AP62821 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Rab1AP62821 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab1AP62821 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rab1AP62821 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab1AP62821 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab1AP62821 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab1AP62821 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rab1AP62821 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab1AP62821 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab1AP62821 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rab1AP62821 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rab1AP62821 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rab1AP62821 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab1AP62821 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab1AP62821 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab1AP62821 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab1AP62821 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rab1AP62821 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab1AP62821 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab1AP62821 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Rab1AP62821 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab1AP62821 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab1AP62821 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rab1AP62821 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rab1AP62821 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rab1AP62821 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Rab1AP62821 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Rab1AP62821 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rab1AP62821 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rab1AP62821 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Rab1AP62821 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rab1AP62821 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Rab1AP62821 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab1AP62821 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Rab1AP62821 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab1AP62821 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab1AP62821 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab1AP62821 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.05■□□□□ -0
Rab1AP62821 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab1AP62821 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab1AP62821 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab1AP62821 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab1AP62821 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rab1AP62821 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Rab1AP62821 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Rab1AP62821 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab1AP62821 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab1AP62821 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab1AP62821 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab1AP62821 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab1AP62821 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab1AP62821 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab1AP62821 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab1AP62821 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rab1AP62821 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rab1AP62821 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab1AP62821 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rab1AP62821 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Rab1AP62821 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Rab1AP62821 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab1AP62821 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab1AP62821 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab1AP62821 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab1AP62821 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab1AP62821 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab1AP62821 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab1AP62821 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab1AP62821 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms