Protein–RNA interactions for Protein: P62748

Hpcal1, Hippocalcin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpcal1P62748 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hpcal1P62748 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hpcal1P62748 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hpcal1P62748 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hpcal1P62748 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hpcal1P62748 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hpcal1P62748 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hpcal1P62748 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hpcal1P62748 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hpcal1P62748 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hpcal1P62748 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hpcal1P62748 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hpcal1P62748 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hpcal1P62748 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hpcal1P62748 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Hpcal1P62748 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hpcal1P62748 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hpcal1P62748 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Hpcal1P62748 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hpcal1P62748 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hpcal1P62748 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Hpcal1P62748 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hpcal1P62748 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hpcal1P62748 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hpcal1P62748 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hpcal1P62748 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hpcal1P62748 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hpcal1P62748 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hpcal1P62748 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hpcal1P62748 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hpcal1P62748 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hpcal1P62748 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hpcal1P62748 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hpcal1P62748 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hpcal1P62748 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hpcal1P62748 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hpcal1P62748 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hpcal1P62748 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hpcal1P62748 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hpcal1P62748 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hpcal1P62748 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hpcal1P62748 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hpcal1P62748 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hpcal1P62748 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hpcal1P62748 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hpcal1P62748 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hpcal1P62748 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Hpcal1P62748 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hpcal1P62748 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hpcal1P62748 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hpcal1P62748 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hpcal1P62748 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hpcal1P62748 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hpcal1P62748 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hpcal1P62748 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hpcal1P62748 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hpcal1P62748 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hpcal1P62748 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hpcal1P62748 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hpcal1P62748 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hpcal1P62748 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hpcal1P62748 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Hpcal1P62748 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hpcal1P62748 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Hpcal1P62748 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Hpcal1P62748 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hpcal1P62748 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hpcal1P62748 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hpcal1P62748 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hpcal1P62748 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hpcal1P62748 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hpcal1P62748 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hpcal1P62748 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hpcal1P62748 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hpcal1P62748 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hpcal1P62748 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hpcal1P62748 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hpcal1P62748 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hpcal1P62748 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hpcal1P62748 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hpcal1P62748 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hpcal1P62748 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hpcal1P62748 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hpcal1P62748 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hpcal1P62748 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Hpcal1P62748 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hpcal1P62748 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hpcal1P62748 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hpcal1P62748 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hpcal1P62748 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hpcal1P62748 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hpcal1P62748 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hpcal1P62748 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hpcal1P62748 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hpcal1P62748 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hpcal1P62748 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Hpcal1P62748 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hpcal1P62748 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hpcal1P62748 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hpcal1P62748 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms