Protein–RNA interactions for Protein: P62515

Pou3f4, POU domain, class 3, transcription factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou3f4P62515 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pou3f4P62515 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pou3f4P62515 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pou3f4P62515 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Pou3f4P62515 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pou3f4P62515 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pou3f4P62515 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Pou3f4P62515 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pou3f4P62515 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Pou3f4P62515 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pou3f4P62515 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Pou3f4P62515 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Pou3f4P62515 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pou3f4P62515 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pou3f4P62515 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pou3f4P62515 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pou3f4P62515 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pou3f4P62515 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pou3f4P62515 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pou3f4P62515 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pou3f4P62515 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pou3f4P62515 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pou3f4P62515 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pou3f4P62515 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pou3f4P62515 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pou3f4P62515 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Pou3f4P62515 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pou3f4P62515 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pou3f4P62515 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pou3f4P62515 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pou3f4P62515 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pou3f4P62515 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pou3f4P62515 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pou3f4P62515 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pou3f4P62515 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pou3f4P62515 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pou3f4P62515 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pou3f4P62515 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Pou3f4P62515 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pou3f4P62515 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Pou3f4P62515 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pou3f4P62515 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Pou3f4P62515 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pou3f4P62515 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pou3f4P62515 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pou3f4P62515 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pou3f4P62515 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pou3f4P62515 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pou3f4P62515 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pou3f4P62515 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pou3f4P62515 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pou3f4P62515 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pou3f4P62515 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pou3f4P62515 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pou3f4P62515 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pou3f4P62515 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pou3f4P62515 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pou3f4P62515 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pou3f4P62515 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pou3f4P62515 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pou3f4P62515 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pou3f4P62515 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pou3f4P62515 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pou3f4P62515 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pou3f4P62515 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pou3f4P62515 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pou3f4P62515 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pou3f4P62515 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pou3f4P62515 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pou3f4P62515 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pou3f4P62515 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pou3f4P62515 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pou3f4P62515 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pou3f4P62515 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pou3f4P62515 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pou3f4P62515 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pou3f4P62515 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pou3f4P62515 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pou3f4P62515 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pou3f4P62515 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pou3f4P62515 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pou3f4P62515 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pou3f4P62515 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pou3f4P62515 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pou3f4P62515 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pou3f4P62515 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pou3f4P62515 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pou3f4P62515 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pou3f4P62515 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pou3f4P62515 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pou3f4P62515 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pou3f4P62515 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pou3f4P62515 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pou3f4P62515 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pou3f4P62515 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pou3f4P62515 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pou3f4P62515 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pou3f4P62515 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pou3f4P62515 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pou3f4P62515 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms