Protein–RNA interactions for Protein: P61924

Copz1, Coatomer subunit zeta-1, mousemouse

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copz1P61924 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Copz1P61924 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Copz1P61924 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Copz1P61924 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Copz1P61924 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Copz1P61924 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Copz1P61924 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Copz1P61924 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Copz1P61924 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Copz1P61924 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Copz1P61924 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Copz1P61924 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Copz1P61924 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Copz1P61924 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Copz1P61924 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Copz1P61924 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Copz1P61924 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Copz1P61924 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Copz1P61924 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Copz1P61924 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Copz1P61924 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Copz1P61924 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Copz1P61924 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Copz1P61924 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Copz1P61924 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Copz1P61924 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Copz1P61924 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Copz1P61924 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Copz1P61924 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Copz1P61924 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Copz1P61924 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Copz1P61924 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Copz1P61924 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Copz1P61924 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Copz1P61924 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Copz1P61924 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Copz1P61924 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Copz1P61924 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Copz1P61924 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Copz1P61924 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Copz1P61924 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Copz1P61924 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Copz1P61924 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Copz1P61924 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Copz1P61924 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Copz1P61924 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Copz1P61924 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Copz1P61924 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Copz1P61924 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Copz1P61924 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Copz1P61924 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Copz1P61924 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Copz1P61924 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Copz1P61924 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Copz1P61924 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Copz1P61924 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Copz1P61924 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Copz1P61924 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Copz1P61924 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Copz1P61924 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Copz1P61924 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Copz1P61924 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Copz1P61924 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Copz1P61924 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Copz1P61924 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Copz1P61924 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Copz1P61924 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Copz1P61924 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Copz1P61924 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Copz1P61924 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Copz1P61924 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Copz1P61924 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Copz1P61924 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Copz1P61924 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Copz1P61924 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Copz1P61924 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Copz1P61924 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Copz1P61924 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Copz1P61924 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Copz1P61924 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Copz1P61924 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Copz1P61924 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Copz1P61924 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Copz1P61924 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Copz1P61924 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Copz1P61924 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Copz1P61924 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Copz1P61924 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Copz1P61924 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Copz1P61924 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Copz1P61924 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Copz1P61924 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Copz1P61924 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Copz1P61924 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Copz1P61924 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Copz1P61924 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Copz1P61924 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Copz1P61924 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Copz1P61924 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Copz1P61924 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms