Protein–RNA interactions for Protein: P60898

Polr2i, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9, mousemouse

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Length 125 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2iP60898 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Polr2iP60898 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Polr2iP60898 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Polr2iP60898 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Polr2iP60898 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Polr2iP60898 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Polr2iP60898 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Polr2iP60898 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Polr2iP60898 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Polr2iP60898 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Polr2iP60898 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Polr2iP60898 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Polr2iP60898 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Polr2iP60898 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Polr2iP60898 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Polr2iP60898 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Polr2iP60898 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Polr2iP60898 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Polr2iP60898 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Polr2iP60898 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Polr2iP60898 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Polr2iP60898 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Polr2iP60898 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Polr2iP60898 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Polr2iP60898 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Polr2iP60898 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Polr2iP60898 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Polr2iP60898 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Polr2iP60898 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Polr2iP60898 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Polr2iP60898 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Polr2iP60898 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Polr2iP60898 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Polr2iP60898 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Polr2iP60898 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Polr2iP60898 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Polr2iP60898 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Polr2iP60898 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Polr2iP60898 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Polr2iP60898 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Polr2iP60898 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Polr2iP60898 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Polr2iP60898 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Polr2iP60898 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Polr2iP60898 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Polr2iP60898 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Polr2iP60898 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Polr2iP60898 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Polr2iP60898 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Polr2iP60898 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Polr2iP60898 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Polr2iP60898 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Polr2iP60898 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Polr2iP60898 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Polr2iP60898 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Polr2iP60898 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Polr2iP60898 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Polr2iP60898 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Polr2iP60898 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Polr2iP60898 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Polr2iP60898 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Polr2iP60898 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Polr2iP60898 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Polr2iP60898 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Polr2iP60898 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Polr2iP60898 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Polr2iP60898 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Polr2iP60898 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Polr2iP60898 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Polr2iP60898 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Polr2iP60898 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Polr2iP60898 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Polr2iP60898 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Polr2iP60898 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Polr2iP60898 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Polr2iP60898 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Polr2iP60898 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Polr2iP60898 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Polr2iP60898 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Polr2iP60898 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Polr2iP60898 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Polr2iP60898 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Polr2iP60898 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Polr2iP60898 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Polr2iP60898 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Polr2iP60898 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Polr2iP60898 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Polr2iP60898 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Polr2iP60898 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Polr2iP60898 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Polr2iP60898 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Polr2iP60898 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Polr2iP60898 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Polr2iP60898 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Polr2iP60898 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Polr2iP60898 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Polr2iP60898 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Polr2iP60898 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Polr2iP60898 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms