Protein–RNA interactions for Protein: P60469

Ppfia3, Liprin-alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia3P60469 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ppfia3P60469 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ppfia3P60469 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ppfia3P60469 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ppfia3P60469 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Ppfia3P60469 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ppfia3P60469 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ppfia3P60469 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ppfia3P60469 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ppfia3P60469 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ppfia3P60469 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ppfia3P60469 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ppfia3P60469 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ppfia3P60469 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ppfia3P60469 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ppfia3P60469 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ppfia3P60469 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Ppfia3P60469 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ppfia3P60469 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ppfia3P60469 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ppfia3P60469 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ppfia3P60469 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ppfia3P60469 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ppfia3P60469 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ppfia3P60469 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ppfia3P60469 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ppfia3P60469 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ppfia3P60469 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ppfia3P60469 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ppfia3P60469 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ppfia3P60469 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ppfia3P60469 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ppfia3P60469 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ppfia3P60469 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ppfia3P60469 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ppfia3P60469 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ppfia3P60469 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ppfia3P60469 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ppfia3P60469 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ppfia3P60469 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ppfia3P60469 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ppfia3P60469 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ppfia3P60469 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ppfia3P60469 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Ppfia3P60469 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ppfia3P60469 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ppfia3P60469 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ppfia3P60469 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ppfia3P60469 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ppfia3P60469 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Ppfia3P60469 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ppfia3P60469 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ppfia3P60469 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ppfia3P60469 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ppfia3P60469 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ppfia3P60469 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ppfia3P60469 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ppfia3P60469 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ppfia3P60469 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ppfia3P60469 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ppfia3P60469 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ppfia3P60469 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ppfia3P60469 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ppfia3P60469 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ppfia3P60469 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ppfia3P60469 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Ppfia3P60469 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ppfia3P60469 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ppfia3P60469 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ppfia3P60469 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ppfia3P60469 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Ppfia3P60469 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ppfia3P60469 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ppfia3P60469 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Ppfia3P60469 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ppfia3P60469 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ppfia3P60469 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ppfia3P60469 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ppfia3P60469 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ppfia3P60469 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
Ppfia3P60469 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ppfia3P60469 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ppfia3P60469 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ppfia3P60469 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ppfia3P60469 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ppfia3P60469 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ppfia3P60469 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ppfia3P60469 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ppfia3P60469 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ppfia3P60469 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ppfia3P60469 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ppfia3P60469 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ppfia3P60469 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ppfia3P60469 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ppfia3P60469 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ppfia3P60469 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ppfia3P60469 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Ppfia3P60469 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ppfia3P60469 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ppfia3P60469 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms