Protein–RNA interactions for Protein: P59438

Hps5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps5P59438 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hps5P59438 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hps5P59438 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hps5P59438 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hps5P59438 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hps5P59438 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hps5P59438 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hps5P59438 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hps5P59438 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hps5P59438 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hps5P59438 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hps5P59438 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hps5P59438 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hps5P59438 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Hps5P59438 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hps5P59438 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hps5P59438 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Hps5P59438 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hps5P59438 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hps5P59438 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.66
Hps5P59438 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hps5P59438 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hps5P59438 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hps5P59438 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hps5P59438 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hps5P59438 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hps5P59438 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hps5P59438 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hps5P59438 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hps5P59438 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hps5P59438 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hps5P59438 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hps5P59438 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hps5P59438 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hps5P59438 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hps5P59438 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hps5P59438 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hps5P59438 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hps5P59438 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hps5P59438 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hps5P59438 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hps5P59438 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hps5P59438 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hps5P59438 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hps5P59438 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hps5P59438 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hps5P59438 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hps5P59438 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hps5P59438 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hps5P59438 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hps5P59438 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hps5P59438 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hps5P59438 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hps5P59438 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hps5P59438 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hps5P59438 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hps5P59438 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Hps5P59438 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hps5P59438 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hps5P59438 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hps5P59438 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hps5P59438 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hps5P59438 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hps5P59438 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hps5P59438 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hps5P59438 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hps5P59438 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hps5P59438 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hps5P59438 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hps5P59438 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Hps5P59438 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hps5P59438 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hps5P59438 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hps5P59438 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hps5P59438 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hps5P59438 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hps5P59438 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hps5P59438 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hps5P59438 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hps5P59438 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hps5P59438 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hps5P59438 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hps5P59438 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hps5P59438 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hps5P59438 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hps5P59438 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hps5P59438 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hps5P59438 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hps5P59438 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hps5P59438 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hps5P59438 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hps5P59438 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Hps5P59438 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hps5P59438 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hps5P59438 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hps5P59438 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hps5P59438 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hps5P59438 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hps5P59438 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hps5P59438 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms