Protein–RNA interactions for Protein: P59240

Nphp4, Nephrocystin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp4P59240 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nphp4P59240 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nphp4P59240 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nphp4P59240 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nphp4P59240 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nphp4P59240 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nphp4P59240 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nphp4P59240 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nphp4P59240 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nphp4P59240 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nphp4P59240 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nphp4P59240 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nphp4P59240 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Nphp4P59240 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nphp4P59240 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Nphp4P59240 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Nphp4P59240 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nphp4P59240 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nphp4P59240 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nphp4P59240 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nphp4P59240 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nphp4P59240 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Nphp4P59240 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nphp4P59240 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nphp4P59240 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nphp4P59240 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nphp4P59240 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nphp4P59240 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nphp4P59240 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nphp4P59240 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nphp4P59240 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nphp4P59240 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nphp4P59240 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nphp4P59240 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nphp4P59240 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nphp4P59240 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nphp4P59240 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nphp4P59240 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nphp4P59240 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nphp4P59240 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nphp4P59240 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nphp4P59240 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nphp4P59240 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nphp4P59240 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nphp4P59240 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nphp4P59240 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Nphp4P59240 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nphp4P59240 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nphp4P59240 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nphp4P59240 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nphp4P59240 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Nphp4P59240 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nphp4P59240 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nphp4P59240 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nphp4P59240 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nphp4P59240 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nphp4P59240 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nphp4P59240 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nphp4P59240 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Nphp4P59240 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nphp4P59240 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nphp4P59240 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nphp4P59240 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nphp4P59240 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nphp4P59240 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nphp4P59240 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nphp4P59240 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nphp4P59240 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nphp4P59240 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nphp4P59240 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nphp4P59240 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nphp4P59240 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nphp4P59240 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nphp4P59240 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nphp4P59240 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Nphp4P59240 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nphp4P59240 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Nphp4P59240 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nphp4P59240 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nphp4P59240 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nphp4P59240 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nphp4P59240 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nphp4P59240 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nphp4P59240 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nphp4P59240 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nphp4P59240 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nphp4P59240 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nphp4P59240 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nphp4P59240 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nphp4P59240 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nphp4P59240 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nphp4P59240 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nphp4P59240 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nphp4P59240 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nphp4P59240 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nphp4P59240 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nphp4P59240 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nphp4P59240 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Nphp4P59240 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nphp4P59240 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms