Protein–RNA interactions for Protein: P59235

Nup43, Nucleoporin Nup43, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup43P59235 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nup43P59235 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nup43P59235 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nup43P59235 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nup43P59235 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nup43P59235 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nup43P59235 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nup43P59235 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nup43P59235 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nup43P59235 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nup43P59235 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Nup43P59235 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nup43P59235 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nup43P59235 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nup43P59235 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nup43P59235 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nup43P59235 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nup43P59235 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nup43P59235 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Nup43P59235 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Nup43P59235 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Nup43P59235 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Nup43P59235 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nup43P59235 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nup43P59235 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nup43P59235 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nup43P59235 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nup43P59235 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Nup43P59235 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nup43P59235 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nup43P59235 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nup43P59235 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nup43P59235 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nup43P59235 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nup43P59235 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nup43P59235 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nup43P59235 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nup43P59235 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nup43P59235 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nup43P59235 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nup43P59235 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nup43P59235 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nup43P59235 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nup43P59235 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nup43P59235 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nup43P59235 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nup43P59235 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nup43P59235 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nup43P59235 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nup43P59235 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nup43P59235 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nup43P59235 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nup43P59235 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nup43P59235 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nup43P59235 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nup43P59235 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nup43P59235 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nup43P59235 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nup43P59235 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nup43P59235 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nup43P59235 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nup43P59235 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nup43P59235 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nup43P59235 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nup43P59235 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nup43P59235 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nup43P59235 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nup43P59235 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nup43P59235 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nup43P59235 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nup43P59235 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nup43P59235 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nup43P59235 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nup43P59235 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nup43P59235 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nup43P59235 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nup43P59235 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nup43P59235 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nup43P59235 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nup43P59235 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nup43P59235 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nup43P59235 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nup43P59235 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nup43P59235 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nup43P59235 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nup43P59235 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nup43P59235 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nup43P59235 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nup43P59235 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nup43P59235 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nup43P59235 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nup43P59235 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nup43P59235 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nup43P59235 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nup43P59235 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nup43P59235 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nup43P59235 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nup43P59235 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Nup43P59235 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Nup43P59235 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms