Protein–RNA interactions for Protein: P59222

Scarf2, Scavenger receptor class F member 2, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarf2P59222 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Scarf2P59222 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Scarf2P59222 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Scarf2P59222 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Scarf2P59222 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Scarf2P59222 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Scarf2P59222 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Scarf2P59222 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Scarf2P59222 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Scarf2P59222 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Scarf2P59222 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Scarf2P59222 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Scarf2P59222 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Scarf2P59222 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Scarf2P59222 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Scarf2P59222 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Scarf2P59222 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Scarf2P59222 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Scarf2P59222 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Scarf2P59222 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Scarf2P59222 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Scarf2P59222 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Scarf2P59222 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Scarf2P59222 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Scarf2P59222 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Scarf2P59222 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Scarf2P59222 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Scarf2P59222 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Scarf2P59222 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Scarf2P59222 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Scarf2P59222 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Scarf2P59222 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Scarf2P59222 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Scarf2P59222 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Scarf2P59222 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Scarf2P59222 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Scarf2P59222 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Scarf2P59222 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Scarf2P59222 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Scarf2P59222 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Scarf2P59222 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Scarf2P59222 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Scarf2P59222 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Scarf2P59222 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Scarf2P59222 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Scarf2P59222 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Scarf2P59222 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Scarf2P59222 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Scarf2P59222 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Scarf2P59222 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Scarf2P59222 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Scarf2P59222 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Scarf2P59222 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Scarf2P59222 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Scarf2P59222 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Scarf2P59222 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Scarf2P59222 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Scarf2P59222 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Scarf2P59222 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Scarf2P59222 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Scarf2P59222 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Scarf2P59222 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Scarf2P59222 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Scarf2P59222 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Scarf2P59222 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Scarf2P59222 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Scarf2P59222 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Scarf2P59222 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Scarf2P59222 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Scarf2P59222 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Scarf2P59222 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Scarf2P59222 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Scarf2P59222 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Scarf2P59222 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Scarf2P59222 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Scarf2P59222 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Scarf2P59222 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Scarf2P59222 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Scarf2P59222 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Scarf2P59222 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Scarf2P59222 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Scarf2P59222 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Scarf2P59222 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Scarf2P59222 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Scarf2P59222 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Scarf2P59222 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Scarf2P59222 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Scarf2P59222 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Scarf2P59222 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Scarf2P59222 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Scarf2P59222 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Scarf2P59222 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Scarf2P59222 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Scarf2P59222 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Scarf2P59222 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Scarf2P59222 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Scarf2P59222 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Scarf2P59222 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Scarf2P59222 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Scarf2P59222 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms