Protein–RNA interactions for Protein: P58242

Smpdl3b, Acid sphingomyelinase-like phosphodiesterase 3b, mousemouse

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpdl3bP58242 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Smpdl3bP58242 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Smpdl3bP58242 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Smpdl3bP58242 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Smpdl3bP58242 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Smpdl3bP58242 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Smpdl3bP58242 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Smpdl3bP58242 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Smpdl3bP58242 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Smpdl3bP58242 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Smpdl3bP58242 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Smpdl3bP58242 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Smpdl3bP58242 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smpdl3bP58242 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smpdl3bP58242 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smpdl3bP58242 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smpdl3bP58242 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Smpdl3bP58242 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smpdl3bP58242 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smpdl3bP58242 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smpdl3bP58242 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smpdl3bP58242 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smpdl3bP58242 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smpdl3bP58242 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smpdl3bP58242 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smpdl3bP58242 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smpdl3bP58242 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Smpdl3bP58242 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smpdl3bP58242 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smpdl3bP58242 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smpdl3bP58242 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smpdl3bP58242 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smpdl3bP58242 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smpdl3bP58242 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smpdl3bP58242 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smpdl3bP58242 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smpdl3bP58242 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smpdl3bP58242 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smpdl3bP58242 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smpdl3bP58242 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smpdl3bP58242 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smpdl3bP58242 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smpdl3bP58242 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smpdl3bP58242 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smpdl3bP58242 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smpdl3bP58242 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smpdl3bP58242 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smpdl3bP58242 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smpdl3bP58242 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smpdl3bP58242 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Smpdl3bP58242 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Smpdl3bP58242 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Smpdl3bP58242 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smpdl3bP58242 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smpdl3bP58242 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smpdl3bP58242 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smpdl3bP58242 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smpdl3bP58242 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smpdl3bP58242 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smpdl3bP58242 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smpdl3bP58242 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smpdl3bP58242 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smpdl3bP58242 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smpdl3bP58242 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smpdl3bP58242 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smpdl3bP58242 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smpdl3bP58242 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smpdl3bP58242 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smpdl3bP58242 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smpdl3bP58242 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Smpdl3bP58242 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smpdl3bP58242 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smpdl3bP58242 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smpdl3bP58242 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smpdl3bP58242 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smpdl3bP58242 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smpdl3bP58242 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smpdl3bP58242 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smpdl3bP58242 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smpdl3bP58242 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smpdl3bP58242 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smpdl3bP58242 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smpdl3bP58242 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smpdl3bP58242 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smpdl3bP58242 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smpdl3bP58242 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smpdl3bP58242 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smpdl3bP58242 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smpdl3bP58242 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smpdl3bP58242 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smpdl3bP58242 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smpdl3bP58242 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smpdl3bP58242 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smpdl3bP58242 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Smpdl3bP58242 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smpdl3bP58242 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Smpdl3bP58242 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smpdl3bP58242 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smpdl3bP58242 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smpdl3bP58242 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms