Protein–RNA interactions for Protein: P58021

Tm9sf2, Transmembrane 9 superfamily member 2, mousemouse

Predictions only

Length 662 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm9sf2P58021 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tm9sf2P58021 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tm9sf2P58021 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tm9sf2P58021 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tm9sf2P58021 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tm9sf2P58021 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tm9sf2P58021 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tm9sf2P58021 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tm9sf2P58021 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tm9sf2P58021 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tm9sf2P58021 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tm9sf2P58021 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tm9sf2P58021 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tm9sf2P58021 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tm9sf2P58021 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tm9sf2P58021 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tm9sf2P58021 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tm9sf2P58021 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Tm9sf2P58021 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Tm9sf2P58021 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tm9sf2P58021 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tm9sf2P58021 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tm9sf2P58021 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tm9sf2P58021 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tm9sf2P58021 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tm9sf2P58021 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tm9sf2P58021 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tm9sf2P58021 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tm9sf2P58021 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tm9sf2P58021 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tm9sf2P58021 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tm9sf2P58021 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Tm9sf2P58021 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tm9sf2P58021 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tm9sf2P58021 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tm9sf2P58021 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tm9sf2P58021 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tm9sf2P58021 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tm9sf2P58021 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Tm9sf2P58021 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Tm9sf2P58021 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Tm9sf2P58021 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tm9sf2P58021 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tm9sf2P58021 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tm9sf2P58021 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tm9sf2P58021 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tm9sf2P58021 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Tm9sf2P58021 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tm9sf2P58021 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tm9sf2P58021 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tm9sf2P58021 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tm9sf2P58021 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tm9sf2P58021 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tm9sf2P58021 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tm9sf2P58021 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tm9sf2P58021 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tm9sf2P58021 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tm9sf2P58021 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tm9sf2P58021 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Tm9sf2P58021 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tm9sf2P58021 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tm9sf2P58021 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tm9sf2P58021 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tm9sf2P58021 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tm9sf2P58021 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tm9sf2P58021 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tm9sf2P58021 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tm9sf2P58021 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tm9sf2P58021 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tm9sf2P58021 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tm9sf2P58021 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tm9sf2P58021 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tm9sf2P58021 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tm9sf2P58021 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tm9sf2P58021 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tm9sf2P58021 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tm9sf2P58021 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tm9sf2P58021 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tm9sf2P58021 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tm9sf2P58021 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tm9sf2P58021 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tm9sf2P58021 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tm9sf2P58021 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tm9sf2P58021 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tm9sf2P58021 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tm9sf2P58021 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tm9sf2P58021 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Tm9sf2P58021 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tm9sf2P58021 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tm9sf2P58021 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tm9sf2P58021 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tm9sf2P58021 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tm9sf2P58021 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tm9sf2P58021 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tm9sf2P58021 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tm9sf2P58021 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tm9sf2P58021 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tm9sf2P58021 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tm9sf2P58021 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tm9sf2P58021 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms