Protein–RNA interactions for Protein: P57716

Ncstn, Nicastrin, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcstnP57716 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NcstnP57716 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NcstnP57716 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NcstnP57716 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NcstnP57716 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
NcstnP57716 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NcstnP57716 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NcstnP57716 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NcstnP57716 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NcstnP57716 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NcstnP57716 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NcstnP57716 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NcstnP57716 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
NcstnP57716 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NcstnP57716 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NcstnP57716 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NcstnP57716 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NcstnP57716 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NcstnP57716 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NcstnP57716 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NcstnP57716 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NcstnP57716 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NcstnP57716 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NcstnP57716 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NcstnP57716 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NcstnP57716 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
NcstnP57716 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
NcstnP57716 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NcstnP57716 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NcstnP57716 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
NcstnP57716 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NcstnP57716 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NcstnP57716 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NcstnP57716 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
NcstnP57716 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NcstnP57716 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NcstnP57716 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NcstnP57716 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NcstnP57716 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NcstnP57716 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NcstnP57716 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NcstnP57716 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NcstnP57716 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NcstnP57716 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NcstnP57716 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
NcstnP57716 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
NcstnP57716 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
NcstnP57716 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NcstnP57716 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NcstnP57716 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NcstnP57716 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NcstnP57716 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NcstnP57716 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NcstnP57716 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NcstnP57716 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NcstnP57716 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NcstnP57716 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NcstnP57716 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NcstnP57716 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NcstnP57716 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NcstnP57716 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NcstnP57716 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NcstnP57716 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
NcstnP57716 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NcstnP57716 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
NcstnP57716 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NcstnP57716 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NcstnP57716 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
NcstnP57716 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NcstnP57716 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NcstnP57716 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NcstnP57716 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NcstnP57716 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NcstnP57716 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NcstnP57716 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NcstnP57716 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NcstnP57716 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NcstnP57716 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NcstnP57716 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NcstnP57716 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NcstnP57716 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NcstnP57716 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NcstnP57716 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NcstnP57716 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NcstnP57716 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NcstnP57716 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NcstnP57716 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NcstnP57716 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NcstnP57716 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NcstnP57716 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NcstnP57716 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NcstnP57716 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NcstnP57716 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NcstnP57716 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NcstnP57716 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NcstnP57716 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
NcstnP57716 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NcstnP57716 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NcstnP57716 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NcstnP57716 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms