Protein–RNA interactions for Protein: P56812

Pdcd5, Programmed cell death protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd5P56812 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdcd5P56812 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdcd5P56812 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdcd5P56812 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdcd5P56812 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdcd5P56812 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdcd5P56812 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdcd5P56812 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdcd5P56812 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdcd5P56812 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdcd5P56812 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdcd5P56812 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdcd5P56812 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdcd5P56812 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdcd5P56812 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdcd5P56812 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdcd5P56812 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdcd5P56812 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdcd5P56812 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdcd5P56812 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdcd5P56812 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdcd5P56812 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdcd5P56812 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdcd5P56812 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdcd5P56812 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdcd5P56812 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdcd5P56812 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdcd5P56812 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdcd5P56812 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdcd5P56812 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdcd5P56812 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdcd5P56812 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdcd5P56812 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdcd5P56812 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdcd5P56812 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdcd5P56812 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdcd5P56812 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdcd5P56812 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdcd5P56812 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdcd5P56812 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdcd5P56812 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdcd5P56812 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdcd5P56812 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdcd5P56812 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdcd5P56812 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdcd5P56812 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdcd5P56812 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdcd5P56812 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdcd5P56812 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdcd5P56812 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdcd5P56812 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdcd5P56812 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdcd5P56812 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdcd5P56812 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdcd5P56812 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdcd5P56812 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdcd5P56812 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdcd5P56812 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdcd5P56812 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdcd5P56812 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdcd5P56812 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdcd5P56812 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdcd5P56812 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdcd5P56812 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdcd5P56812 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdcd5P56812 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdcd5P56812 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdcd5P56812 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdcd5P56812 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdcd5P56812 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdcd5P56812 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdcd5P56812 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdcd5P56812 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdcd5P56812 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdcd5P56812 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdcd5P56812 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdcd5P56812 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdcd5P56812 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdcd5P56812 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdcd5P56812 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdcd5P56812 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdcd5P56812 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdcd5P56812 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdcd5P56812 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdcd5P56812 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdcd5P56812 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdcd5P56812 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pdcd5P56812 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Pdcd5P56812 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pdcd5P56812 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pdcd5P56812 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pdcd5P56812 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pdcd5P56812 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pdcd5P56812 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pdcd5P56812 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pdcd5P56812 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pdcd5P56812 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pdcd5P56812 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pdcd5P56812 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pdcd5P56812 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms