Protein–RNA interactions for Protein: P56399

Usp5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp5P56399 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Usp5P56399 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Usp5P56399 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Usp5P56399 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Usp5P56399 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Usp5P56399 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Usp5P56399 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Usp5P56399 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Usp5P56399 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Usp5P56399 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Usp5P56399 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Usp5P56399 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Usp5P56399 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Usp5P56399 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Usp5P56399 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Usp5P56399 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Usp5P56399 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Usp5P56399 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Usp5P56399 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Usp5P56399 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Usp5P56399 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Usp5P56399 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Usp5P56399 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Usp5P56399 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Usp5P56399 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Usp5P56399 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Usp5P56399 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Usp5P56399 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Usp5P56399 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Usp5P56399 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Usp5P56399 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Usp5P56399 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Usp5P56399 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Usp5P56399 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Usp5P56399 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Usp5P56399 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Usp5P56399 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Usp5P56399 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Usp5P56399 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Usp5P56399 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Usp5P56399 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Usp5P56399 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Usp5P56399 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Usp5P56399 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Usp5P56399 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Usp5P56399 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Usp5P56399 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Usp5P56399 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Usp5P56399 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Usp5P56399 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Usp5P56399 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Usp5P56399 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Usp5P56399 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Usp5P56399 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Usp5P56399 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Usp5P56399 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Usp5P56399 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Usp5P56399 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp5P56399 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp5P56399 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp5P56399 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp5P56399 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp5P56399 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp5P56399 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp5P56399 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp5P56399 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp5P56399 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp5P56399 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp5P56399 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Usp5P56399 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Usp5P56399 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Usp5P56399 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Usp5P56399 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Usp5P56399 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Usp5P56399 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Usp5P56399 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Usp5P56399 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Usp5P56399 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Usp5P56399 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Usp5P56399 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Usp5P56399 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Usp5P56399 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Usp5P56399 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Usp5P56399 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Usp5P56399 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Usp5P56399 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Usp5P56399 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Usp5P56399 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Usp5P56399 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Usp5P56399 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Usp5P56399 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Usp5P56399 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Usp5P56399 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Usp5P56399 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Usp5P56399 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Usp5P56399 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Usp5P56399 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Usp5P56399 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Usp5P56399 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Usp5P56399 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms