Protein–RNA interactions for Protein: P56382

Atp5e, ATP synthase subunit epsilon, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5eP56382 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Atp5eP56382 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Atp5eP56382 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Atp5eP56382 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Atp5eP56382 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Atp5eP56382 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Atp5eP56382 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Atp5eP56382 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Atp5eP56382 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Atp5eP56382 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Atp5eP56382 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Atp5eP56382 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Atp5eP56382 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Atp5eP56382 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Atp5eP56382 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Atp5eP56382 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Atp5eP56382 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Atp5eP56382 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atp5eP56382 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atp5eP56382 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atp5eP56382 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atp5eP56382 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atp5eP56382 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Atp5eP56382 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atp5eP56382 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atp5eP56382 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atp5eP56382 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atp5eP56382 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atp5eP56382 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atp5eP56382 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atp5eP56382 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Atp5eP56382 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Atp5eP56382 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atp5eP56382 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atp5eP56382 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atp5eP56382 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atp5eP56382 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atp5eP56382 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atp5eP56382 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atp5eP56382 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atp5eP56382 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atp5eP56382 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atp5eP56382 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atp5eP56382 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atp5eP56382 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atp5eP56382 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atp5eP56382 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atp5eP56382 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atp5eP56382 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atp5eP56382 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atp5eP56382 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Atp5eP56382 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Atp5eP56382 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Atp5eP56382 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Atp5eP56382 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Atp5eP56382 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Atp5eP56382 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Atp5eP56382 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Atp5eP56382 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Atp5eP56382 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Atp5eP56382 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Atp5eP56382 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Atp5eP56382 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Atp5eP56382 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Atp5eP56382 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Atp5eP56382 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Atp5eP56382 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Atp5eP56382 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Atp5eP56382 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Atp5eP56382 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Atp5eP56382 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Atp5eP56382 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Atp5eP56382 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Atp5eP56382 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Atp5eP56382 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Atp5eP56382 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Atp5eP56382 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Atp5eP56382 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Atp5eP56382 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Atp5eP56382 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Atp5eP56382 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Atp5eP56382 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Atp5eP56382 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Atp5eP56382 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Atp5eP56382 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Atp5eP56382 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Atp5eP56382 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Atp5eP56382 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Atp5eP56382 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Atp5eP56382 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Atp5eP56382 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Atp5eP56382 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Atp5eP56382 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Atp5eP56382 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Atp5eP56382 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Atp5eP56382 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Atp5eP56382 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Atp5eP56382 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Atp5eP56382 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Atp5eP56382 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms