Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sh3bp1P55194 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sh3bp1P55194 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sh3bp1P55194 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sh3bp1P55194 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sh3bp1P55194 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sh3bp1P55194 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sh3bp1P55194 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sh3bp1P55194 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sh3bp1P55194 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sh3bp1P55194 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sh3bp1P55194 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sh3bp1P55194 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sh3bp1P55194 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sh3bp1P55194 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sh3bp1P55194 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sh3bp1P55194 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sh3bp1P55194 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sh3bp1P55194 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sh3bp1P55194 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Sh3bp1P55194 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sh3bp1P55194 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sh3bp1P55194 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sh3bp1P55194 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Sh3bp1P55194 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sh3bp1P55194 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sh3bp1P55194 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sh3bp1P55194 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sh3bp1P55194 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sh3bp1P55194 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sh3bp1P55194 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sh3bp1P55194 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sh3bp1P55194 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sh3bp1P55194 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sh3bp1P55194 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sh3bp1P55194 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sh3bp1P55194 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sh3bp1P55194 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sh3bp1P55194 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sh3bp1P55194 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sh3bp1P55194 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Sh3bp1P55194 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sh3bp1P55194 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sh3bp1P55194 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sh3bp1P55194 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sh3bp1P55194 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sh3bp1P55194 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sh3bp1P55194 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sh3bp1P55194 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sh3bp1P55194 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sh3bp1P55194 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sh3bp1P55194 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sh3bp1P55194 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
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Sh3bp1P55194 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sh3bp1P55194 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sh3bp1P55194 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sh3bp1P55194 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sh3bp1P55194 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
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Sh3bp1P55194 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sh3bp1P55194 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sh3bp1P55194 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sh3bp1P55194 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Sh3bp1P55194 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sh3bp1P55194 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sh3bp1P55194 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sh3bp1P55194 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sh3bp1P55194 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sh3bp1P55194 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sh3bp1P55194 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sh3bp1P55194 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sh3bp1P55194 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sh3bp1P55194 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Sh3bp1P55194 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sh3bp1P55194 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sh3bp1P55194 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sh3bp1P55194 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sh3bp1P55194 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sh3bp1P55194 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Sh3bp1P55194 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sh3bp1P55194 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sh3bp1P55194 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sh3bp1P55194 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Sh3bp1P55194 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sh3bp1P55194 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sh3bp1P55194 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sh3bp1P55194 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
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