Protein–RNA interactions for Protein: P55098

Pex2, Peroxisome biogenesis factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pex2P55098 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pex2P55098 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pex2P55098 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Pex2P55098 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pex2P55098 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pex2P55098 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Pex2P55098 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pex2P55098 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pex2P55098 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pex2P55098 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pex2P55098 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pex2P55098 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pex2P55098 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pex2P55098 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pex2P55098 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pex2P55098 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pex2P55098 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pex2P55098 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pex2P55098 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pex2P55098 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pex2P55098 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pex2P55098 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pex2P55098 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pex2P55098 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pex2P55098 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pex2P55098 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pex2P55098 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pex2P55098 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pex2P55098 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pex2P55098 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pex2P55098 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pex2P55098 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pex2P55098 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pex2P55098 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pex2P55098 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pex2P55098 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pex2P55098 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pex2P55098 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pex2P55098 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pex2P55098 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pex2P55098 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pex2P55098 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pex2P55098 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pex2P55098 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pex2P55098 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pex2P55098 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pex2P55098 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pex2P55098 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pex2P55098 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pex2P55098 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pex2P55098 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pex2P55098 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pex2P55098 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pex2P55098 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pex2P55098 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pex2P55098 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pex2P55098 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pex2P55098 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pex2P55098 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pex2P55098 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pex2P55098 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pex2P55098 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pex2P55098 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pex2P55098 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pex2P55098 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pex2P55098 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pex2P55098 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pex2P55098 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pex2P55098 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pex2P55098 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pex2P55098 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pex2P55098 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pex2P55098 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pex2P55098 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pex2P55098 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pex2P55098 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pex2P55098 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pex2P55098 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pex2P55098 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Pex2P55098 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Pex2P55098 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pex2P55098 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pex2P55098 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pex2P55098 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pex2P55098 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Pex2P55098 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pex2P55098 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pex2P55098 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pex2P55098 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pex2P55098 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pex2P55098 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pex2P55098 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pex2P55098 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pex2P55098 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pex2P55098 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pex2P55098 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pex2P55098 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pex2P55098 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pex2P55098 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pex2P55098 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms