Protein–RNA interactions for Protein: P55014

Slc12a1, Solute carrier family 12 member 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,095 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc12a1P55014 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc12a1P55014 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc12a1P55014 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc12a1P55014 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc12a1P55014 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc12a1P55014 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc12a1P55014 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc12a1P55014 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc12a1P55014 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc12a1P55014 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Slc12a1P55014 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Slc12a1P55014 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Slc12a1P55014 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Slc12a1P55014 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Slc12a1P55014 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Slc12a1P55014 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Slc12a1P55014 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc12a1P55014 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc12a1P55014 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc12a1P55014 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc12a1P55014 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc12a1P55014 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc12a1P55014 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc12a1P55014 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc12a1P55014 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc12a1P55014 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc12a1P55014 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc12a1P55014 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc12a1P55014 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc12a1P55014 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc12a1P55014 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc12a1P55014 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc12a1P55014 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc12a1P55014 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc12a1P55014 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc12a1P55014 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc12a1P55014 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc12a1P55014 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc12a1P55014 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc12a1P55014 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc12a1P55014 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc12a1P55014 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc12a1P55014 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc12a1P55014 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc12a1P55014 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc12a1P55014 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc12a1P55014 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc12a1P55014 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc12a1P55014 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc12a1P55014 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc12a1P55014 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc12a1P55014 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc12a1P55014 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc12a1P55014 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc12a1P55014 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc12a1P55014 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc12a1P55014 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc12a1P55014 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc12a1P55014 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc12a1P55014 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc12a1P55014 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc12a1P55014 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc12a1P55014 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc12a1P55014 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc12a1P55014 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc12a1P55014 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc12a1P55014 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc12a1P55014 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc12a1P55014 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc12a1P55014 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc12a1P55014 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc12a1P55014 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc12a1P55014 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc12a1P55014 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc12a1P55014 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc12a1P55014 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc12a1P55014 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc12a1P55014 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc12a1P55014 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc12a1P55014 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc12a1P55014 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc12a1P55014 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc12a1P55014 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc12a1P55014 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc12a1P55014 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc12a1P55014 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc12a1P55014 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc12a1P55014 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc12a1P55014 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc12a1P55014 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc12a1P55014 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc12a1P55014 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc12a1P55014 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc12a1P55014 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc12a1P55014 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc12a1P55014 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc12a1P55014 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc12a1P55014 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc12a1P55014 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc12a1P55014 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms